Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

AAATGAGGATTTGATGGAGACCTTGACTCTGGAAGAGAAAAGGGAATGGGTTGACAGTAGTCCAACCCGTGTCTTTGAAATTGATCCAGTGACACAACAGgttcggtttttatcgtttgtactcttatgattttggttatgcatttttaactagtgttatctgatccatattttgtgcagaatgaatgaataattaccta...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA20G02360.1
intron # 2
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|193707865|gb|FK647661.1|FK647661
EST:     TTGATCCAGTGACACAACAG                         GTCATGGTGGTTGATGCTGAGGCATACACATATGATGACGAGGTGCTTAAG
genomic: TTGATCCAGTGACACAACAGgttcggtttt ... catttattagGTCATGGTGGTTGATGCTGAGGCATACACATATGATGACGAGGTGCTTAAG
EST: gi|13790386|gb|BG652977.1|BG652977
EST:     TTGACAGTAGTCCAACCCGTGTCTTTGAAATTGATCCAGTGACACAACAG                         GTCATGGTGGTTGATGCTGAGGCATACACATATG
genomic: TTGACAGTAGTCCAACCCGTGTCTTTGAAATTGATCCAGTGACACAACAGgttcggtttt ... catttattagGTCATGGTGGTTGATGCTGAGGCATACACATATG
EST: gi|208332035|gb|GE127698.1|GE127698
EST:     TTGACAGTAGTCCAACCCGTGTCTTTGAAATTGATCCAGTGACACAACAG                         GTCATGGTGGTTGATGCTGAGGCATACACATATGATGACGAGGTGCTTAAG
genomic: TTGACAGTAGTCCAACCCGTGTCTTTGAAATTGATCCAGTGACACAACAGgttcggtttt ... catttattagGTCATGGTGGTTGATGCTGAGGCATACACATATGATGACGAGGTGCTTAAG
EST: gi|208153490|gb|GD945723.1|GD945723
EST:     TTGACAGTAGTCCAACCCGTGTCTTTGAAATTGATCCAGTGACACAACAG                         GTCATGGTGGTTGATGCTGAGG
genomic: TTGACAGTAGTCCAACCCGTGTCTTTGAAATTGATCCAGTGACACAACAGgttcggtttt ... catttattagGTCATGGTGGTTGATGCTGAGG
EST: gi|193623900|gb|FK573822.1|FK573822
EST:     TAGTCCAACCCGTGTCTTTGAAATTGATCCAGTGACACAACAG                         GTCATGGTGGTTGATGCTGAGGCATACACATATGATGACGAGGTGCTTAAG
genomic: TAGTCCAACCCGTGTCTTTGAAATTGATCCAGTGACACAACAGgttcggtttt ... catttattagGTCATGGTGGTTGATGCTGAGGCATACACATATGATGACGAGGTGCTTAAG
EST: gi|120531834|gb|EH259967.1|EH259967
EST:     TTGACAGTAGTCCAACCCGTGTCTTTGAAATTGATCCAGTGACACAACAG                         GTCATGGTGGTTGATGCTGAG
genomic: TTGACAGTAGTCCAACCCGTGTCTTTGAAATTGATCCAGTGACACAACAGgttcggtttt ... catttattagGTCATGGTGGTTGATGCTGAG
EST: gi|208250412|gb|GE044649.1|GE044649
EST:     TTGACAGTAGTCCAACCCGTGTCTTTGAAATTGATCCAGTGACACAACAG                         GTCATGGTGGTTGATGCTGAGGCATACACATAT
genomic: TTGACAGTAGTCCAACCCGTGTCTTTGAAATTGATCCAGTGACACAACAGgttcggtttt ... catttattagGTCATGGTGGTTGATGCTGAGGCATACACATAT
EST: gi|208321527|gb|GE120784.1|GE120784
EST:     TTGACAGTAGTCCAACCCGTGTCTTTGAAATTGTTCCAGTGACACAACAG                         GTCATGGTGGTTGATGCTGAGGCATACACATATGATGACGAGGTGCTTAAA
genomic: TTGACAGTAGTCCAACCCGTGTCTTTGAAATTGATCCAGTGACACAACAGgttcggtttt ... catttattagGTCATGGTGGTTGATGCTGAGGCATACACATATGATGACGAGGTGCTTAA-
EST: gi|120531458|gb|EH259591.1|EH259591
EST:     TTGACAGTAGTCCAACCCGTGTCTTTGAAATTGATCCAGTGACACAACAG                         GTCATGGTGGTTGATGCTGAGGCATACACATATGATGACGAGGTGCTTAAG
genomic: TTGACAGTAGTCCAACCCGTGTCTTTGAAATTGATCCAGTGACACAACAGgttcggtttt ... catttattagGTCATGGTGGTTGATGCTGAGGCATACACATATGATGACGAGGTGCTTAAG
EST: gi|254315328|gb|GR825137.1|GR825137
EST:     TGTCTTTGAAATTGATCCCAGTGACACAAACAG                         GTCATGGTGGTTGATGCTGAGGCATACACATATGATGACGAGGTGCTTAA
genomic: TGTCTTTGAAATTGAT-CCAGTGACAC-AACAGgttcggtttt ... catttattagGTCATGGTGGTTGATGCTGAGGCATACACATATGATGACGAGGTGCTTAA