1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
ATTGATGTCCTCGAGGTTGATGGAGTCTATTATGgtatgtgttttttttggattgtgtatggaatcttataattattattacataacttggtcatgctcatagctaaaaaacagtaaaatcagaaacttgaaggacttgaaagatctaccatgatggaataacttgttttcaagatccatccatgccttctcactgtggaaaatcaatatgtcctttatctttggtttgtag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA20G02350.3 |
intron # | 3 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: ATTGATGTCCTCGAGGTTGATGGAGTCTATTATG GTTTCTCCGGCTGTCACCGCTATGAGGCTCATCAGCGCCTTGGACTCCCCAEST: gi|298188808|gb|HO035501.1|HO035501
genomic: ATTGATGTCCTCGAGGTTGATGGAGTCTATTATGgtatgtgttt ... tggtttgtagGTTTCTCCGGCTGTCACCGCTATGAGGCTCATCAGCGCCTTGGACTCCCCA
EST: ATTGATGTCCTCGAGGTTGATGGAGTCTATTATG GTTTCTCCGGCTGTCACCGCTATGAGGCTCATCAGCGCCTTGGACTCCCCAEST: gi|151410335|gb|EV280150.1|EV280150
genomic: ATTGATGTCCTCGAGGTTGATGGAGTCTATTATGgtatgtgttt ... tggtttgtagGTTTCTCCGGCTGTCACCGCTATGAGGCTCATCAGCGCCTTGGACTCCCCA
EST: ATTGATGTCCTCGAGGTTGATGGAGTCTATTATG GTTTCTCCGGCTGTCACCGCTATGAGGCTCATCAGCGCCTTGGACTCCCCAEST: gi|254347054|gb|GR856724.1|GR856724
genomic: ATTGATGTCCTCGAGGTTGATGGAGTCTATTATGgtatgtgttt ... tggtttgtagGTTTCTCCGGCTGTCACCGCTATGAGGCTCATCAGCGCCTTGGACTCCCCA
EST: ATTGATGTCCTCGAGGTTGATGGAGTCTATTATG GTTTCTCCGGCTGTCACCGCTATGAGGCTCATCAGCGCCTTGGACTCCCCAEST: gi|208102742|gb|GD897483.1|GD897483
genomic: ATTGATGTCCTCGAGGTTGATGGAGTCTATTATGgtatgtgttt ... tggtttgtagGTTTCTCCGGCTGTCACCGCTATGAGGCTCATCAGCGCCTTGGACTCCCCA
EST: ATTGATGTCCTCGAGGTTGATGGAGTCTATTATG GTTTCTCCGGCTGTCACCGCTATGAGGCTCATCAGCGCCTTGGACTCCCCAEST: gi|298194077|gb|HO040725.1|HO040725
genomic: ATTGATGTCCTCGAGGTTGATGGAGTCTATTATGgtatgtgttt ... tggtttgtagGTTTCTCCGGCTGTCACCGCTATGAGGCTCATCAGCGCCTTGGACTCCCCA
EST: ATTGATGTCCTCGAGGTTGATGGAGTCTATTATG GTTTCTCCGGTTGTCACCGCTATGAGGCTCATCAGCGCCTTGGACTCCCCAEST: gi|207769856|gb|GD742170.1|GD742170
genomic: ATTGATGTCCTCGAGGTTGATGGAGTCTATTATGgtatgtgttt ... tggtttgtagGTTTCTCCGGCTGTCACCGCTATGAGGCTCATCAGCGCCTTGGACTCCCCA
EST: ATTGATGTCCTCGAGGTTGATGGAGTCTATTATG GTTTCTCCGGCTGTCACCGCTATGAGGCTCATCAGCGCCTTGGACTCCCCAEST: gi|193530672|gb|FK484491.1|FK484491
genomic: ATTGATGTCCTCGAGGTTGATGGAGTCTATTATGgtatgtgttt ... tggtttgtagGTTTCTCCGGCTGTCACCGCTATGAGGCTCATCAGCGCCTTGGACTCCCCA
EST: GTCCTCGAGGTTGATGGAGTCTATTATG GTTTCTCCGGCTGTCACCGCTATGAGGCTCATCAGCGCCTTGGACTCCCCA
genomic: GTCCTCGAGGTTGATGGAGTCTATTATGgtatgtgttt ... tggtttgtagGTTTCTCCGGCTGTCACCGCTATGAGGCTCATCAGCGCCTTGGACTCCCCA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| ATTGATGTCCTCGAGGTTGATGGAGTCTATTATGgtatgtgttttttttggattgtgtatggaatcttataattattattacataacttggtcatgctcatagctaaaaaacagtaaaatcagaaacttgaaggacttgaaagatctaccatgatggaataacttgttttcaagatccatccatgccttctcactgtggaaaatcaatatgtcctttatctttggtttgtag
- - - - - - - - - GATGGA