1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
GAGGGTTCCCACTGTGGTTTCAAATTATCAAAAAGAAGAGACAGGGGAGGCTGCTGCCGGAGGTTGTGGTCGTAACTGCCTCAAAAGTTGTTGCATTCAAggtggttttttttatggtttttgtttttctggtttgaatgtgtgatatgaggttttaaatatcggtccgcgattgcaattttggctgcaaggttaatgat...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA18G10430.1 |
intron # | 1 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: CTGCTGCCGGAGGTTGTGGTCGTAACTGCCTCAAAAGTTGTTGCATTCAA GGTAGACGAAGACTGCCTTTGTATGCTTTCAAGAAGEST: gi|208169327|gb|GD970942.1|GD970942
genomic: CTGCTGCCGGAGGTTGTGGTCGTAACTGCCTCAAAAGTTGTTGCATTCAAggtggttttt ... ttcggggacaGGT-G-CGA-GACTGCCTTTGTATGCTTTCAAGAAG
EST: CTGCTGCCGGAGGTTGTGGTCGTAACTGCCTCAAAAGTTGTTGCATTCAA GGTGCGAGACTGCCTTTGTATGCTTTCAAGAAGEST: gi|120532602|gb|EH260735.1|EH260735
genomic: CTGCTGCCGGAGGTTGTGGTCGTAACTGCCTCAAAAGTTGTTGCATTCAAggtggttttt ... ttcggggacaGGTGCGAGACTGCCTTTGTATGCTTTCAAGAAG
EST: CTGCTGCCGGAGGTTGTGGTCGTAACTGCCTCAAAAGTTGTTGCATTCAA GGTGCGAGACTGCCTTTGTATGCTTTCAAGAAGGTGGACAAGGTTTGTGGA
genomic: CTGCTGCCGGAGGTTGTGGTCGTAACTGCCTCAAAAGTTGTTGCATTCAAggtggttttt ... ttcggggacaGGTGCGAGACTGCCTTTGTATGCTTTCAAGAAGGTGGACAAGGTTTGTGGA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GAGGGTTCCCACTGTGGTTTCAAATTATCAAAAAGAAGAGACAGGGGAGGCTGCTGCCGGAGGTTGTGGTCGTAACTGCCTCAAAAGTTGTTGCATTCAAggtggttttttttatggtttttgtttttctggtttgaatgtgtgatatgaggttttaaatatcggtccgcgattgcaattttggctgcaaggttaatgat
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGCTGC