Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TTGGAATGCAACTTATGAAAGTTTGCTTGGAACTAGACAACCTTTCCCCAAGCCCATACCTTTATCTgtaagtgctgtgtatatttatggttccttgctgggatttttgaggtgagaatgcaaaaattacaaattgataatttgattttcaaaaaatag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA17G12280.1
intron # 5
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|192325941|gb|FK016618.1|FK016618
EST:     AAAGTTTGCTTGGAACTAGACAACCTTTCCCCAAGCCCATACCTTTATCT                         GAAATGGTTGAATTCCTGGTGGATGTTTGGGAGCGTGAAGGGATGTATGGT
genomic: AAAGTTTGCTTGGAACTAGACAACCTTTCCCCAAGCCCATACCTTTATCTgtaagtgctg ... caaaaaatagGAAATGGTTGAATTCCTGGTGGATGTTTGGGAGCGTGAAGGGATGTATGGT
EST: gi|214005955|gb|DB986558.1|DB986558
EST:     AAAGTTTGCTTGGAACTAGACAACCTTTCCCCAAGCCCATACCTTTATCT                         GAAATGGTTGAATTCCTGGTGGATGTTTGGGAGCGTGAAGGGATGTATGGT
genomic: AAAGTTTGCTTGGAACTAGACAACCTTTCCCCAAGCCCATACCTTTATCTgtaagtgctg ... caaaaaatagGAAATGGTTGAATTCCTGGTGGATGTTTGGGAGCGTGAAGGGATGTATGGT
EST: gi|57574170|gb|CX547145.1|CX547145
EST:     AAAGTTTGCTTGGAACTAGACAACCTTTCCCCAAGCCCATACCTTTATTT                         GAAATGGTTGAATTCCTGGTGGATGTTTGGGAGCGTGAAGGGATGTATGGT
genomic: AAAGTTTGCTTGGAACTAGACAACCTTTCCCCAAGCCCATACCTTTATCTgtaagtgctg ... caaaaaatagGAAATGGTTGAATTCCTGGTGGATGTTTGGGAGCGTGAAGGGATGTATGGT