Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GAGGATGTCTGGTGGCACACAGAAGAGTCTGAGAAAAGCACTTGGAGCCCTTAAGGACACCACAACAGTCTCGTTGGCTAAGGTCAACAGTGATTACAAGgtattagaatagactctgttggatatgggatcactggatcaggtgttttgtgtttgttctcaatgggtttatttattattgtgttccag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA17G11910.1
intron # 2
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|6719830|gb|AW307477.1|AW307477
EST:     GGACACCACAACAGTCTCGTTGGCTAAGGTCAACAGTGATTACAAG                         GAATTGGACATTGCTATAGTTAGAGCCACAAATCATGTTGAACGTCCGGCT
genomic: GGACACCACAACAGTCTCGTTGGCTAAGGTCAACAGTGATTACAAGgtattagaat ... tgtgttccagGAATTGGACATTGCTATAGTTAGAGCCACAAATCATGTTGAACGTCCGGCT
EST: gi|14125906|gb|BG790344.1|BG790344
EST:     TTAAGGACACCACAACAGTCTCGTTGGCTAAGGTCAACAGTGATTACAAG                         GAATTGGACATTGCTATAGTTAGAGCCACAAATCATGTTGAACGTCCGGCT
genomic: TTAAGGACACCACAACAGTCTCGTTGGCTAAGGTCAACAGTGATTACAAGgtattagaat ... tgtgttccagGAATTGGACATTGCTATAGTTAGAGCCACAAATCATGTTGAACGTCCGGCT