1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
TTATGGAAGTGGAAAGGAAGATAGTCCTATGTGTGATGTGCCAGGATTTGAAAACAGCAAGATGAAATTGCTGAGACATGTTTCATTTGTGGATTGTCCGgtaaagtcctgaacttacatttgttatttagggttgttttatgcataatttcgttatagataatatggatatgcctgcacatttggttatatatattgag...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA15G40750.1 |
intron # | 5 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: AAAACAGCAAGATGAAATTGCTGAGACATGTTTCATTTGTGGATTGTCCG GGACATGATATTCTTATGGCTACAATGCTTAATGGAGCAGCAATCATGGATEST: gi|209700869|gb|BW683099.1|BW683099
genomic: AAAACAGCAAGATGAAATTGCTGAGACATGTTTCATTTGTGGATTGTCCGgtaaagtcct ... atttctgcagGGACATGATATTCTTATGGCTACAATGCTTAATGGAGCAGCAATCATGGAT
EST: AAAACAGCAAGATGAAATTGCTGAGACATGTTTCATTTGTGGATTGTCCG GGACATGATATTCTTATGGCTACAATGCTTAATGGAGCAGCAATCATGGATEST: gi|192301270|gb|FG990190.1|FG990190
genomic: AAAACAGCAAGATGAAATTGCTGAGACATGTTTCATTTGTGGATTGTCCGgtaaagtcct ... atttctgcagGGACATGATATTCTTATGGCTACAATGCTTAATGGAGCAGCAATCATGGAT
EST: AAAACAGCAAGATGAAATTGCTGAGACATGTTTCATTTGTGGATTGTCCG GGACATGATATTCTTATGGCTACAATGCTTAATGGAGCAGCAATCATGGATEST: gi|192298646|gb|FG988557.1|FG988557
genomic: AAAACAGCAAGATGAAATTGCTGAGACATGTTTCATTTGTGGATTGTCCGgtaaagtcct ... atttctgcagGGACATGATATTCTTATGGCTACAATGCTTAATGGAGCAGCAATCATGGAT
EST: AAAACAGCAAGATGAAATTGCTGAGACATGTTTCATTTGTGGATTGTCCG GGACATGATATTCTTATGGCTACAATGCTTAATGGAGCAGCAATCATGGATEST: gi|192296353|gb|FG991591.1|FG991591
genomic: AAAACAGCAAGATGAAATTGCTGAGACATGTTTCATTTGTGGATTGTCCGgtaaagtcct ... atttctgcagGGACATGATATTCTTATGGCTACAATGCTTAATGGAGCAGCAATCATGGAT
EST: AAAACAGCAAGATGAAATTGCTGAGACATGTTTCATTTGTGGATTGTCCG GGACATGATATTCTTATGGCTACAATGCTTAATGGAGCAGCAATCATGGAT
genomic: AAAACAGCAAGATGAAATTGCTGAGACATGTTTCATTTGTGGATTGTCCGgtaaagtcct ... atttctgcagGGACATGATATTCTTATGGCTACAATGCTTAATGGAGCAGCAATCATGGAT
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TTATGGAAGTGGAAAGGAAGATAGTCCTATGTGTGATGTGCCAGGATTTGAAAACAGCAAGATGAAATTGCTGAGACATGTTTCATTTGTGGATTGTCCGgtaaagtcctgaacttacatttgttatttagggttgttttatgcataatttcgttatagataatatggatatgcctgcacatttggttatatatattgag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGCAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCAAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGATG