1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
gtaagttttgctggtccttggaacttgatatctgtggaaatgttacatgggacattatatgcaatgcagGTCAGACGACGAGCTTGTGACTTGGGAAAGCTCTTCCTGGGGCGAAGCGGCTGGATTTCTGTATTGTTGTAACCTAACTTATTTCACCTTTACTGGTATT
species | Glycine max |
transcript | GLYMA12G08900.1 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ATACAAATTGGCTTGTCTGGCGGTATATGCAACCTGTTTTGTTTTAATGG GTCAGACGACGAGCTTGTGACTTGGGAAAGCTCTTCCTGGGGCGAAGCGGCEST: gi|8286376|gb|BE023935.1|BE023935
genomic: ATACAAATTGGCTTGTCTGGCGGTATATGCAACCTGTTTTGTTTTAATGGgtaagttttg ... tgcaatgcagGTCAGACGACGAGCTTGTGACTTGGGAAAGCTCTTCCTGGGGCGAAGCGGC
EST: ATACAAATTGGCTTGTCTGGCGGTATATGCAACCTGTTTTGTTTTAATGG GTCAGACGACGAGCTTGTGACTTGNGAAAGCTCTTCCTGNGGCGAAGCGGC
genomic: ATACAAATTGGCTTGTCTGGCGGTATATGCAACCTGTTTTGTTTTAATGGgtaagttttg ... tgcaatgcagGTCAGACGACGAGCTTGTGACTTGGGAAAGCTCTTCCTGGGGCGAAGCGGC
tccttggaacttgatatctgtggaaatgttacatgggacattatatgcaatgcagGTCAGACGACGAGCTTGTGACTTGGGAAAGCTCTTCCTGGGGCGAAGCGGCTGGATTTCTGTATTGTTGTAACCTAACTTATTTCACCTTTACTGGTATT
acttgat putative branch site (score: 5)
acattatat TA-rich tract