Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

AAACTGTGCCTGTTAGGACCGTTAATAGGCAATGTTCATCTGGGCTCCAGGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTGgtaaaggatgcatcaaattgctgttttcttcttgtgattgatatgacttttagtatcttatgttgcctttaattattttgtttag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA10G24590.3
intron # 5
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA10G24590.3 (Glycine max), 5'ss of exon 5
lower sequence: GRMZM5G848768_T01 (Zea mays), 5'ss of exon 5
AAACTGTGCCTGTTAGGACCGTTAATAGGCAATGTTCATCTGGGCTCCAGGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTGgtaaaggatgcatcaaattgctgttttcttcttgtgattgatatgacttttagtatcttatgttgcctttaattattttgtttag
|||| || |||||||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||| |||||| | ||||||||| ||||     |   | ||  | |    | |||    |                                                  
AAACCGTCCCTGTTAGAACTGTCAACCGCCAGTGttcatctgggctacaggcagtagctgatgtcgcagctgctataaaggctggttactatgacataggtacttagtatctgaatatacatgctactttcgct--------------------------------------------------

upper sequence: GLYMA10G24590.3 (Glycine max), 5'ss of exon 5
lower sequence: GRMZM5G848768_T02 (Zea mays), 5'ss of exon 5
AAACTGTGCCTGTTAGGACCGTTAATAGGCAATGTTCATCTGGGCTCCAGGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTGgtaa--aggat--gcatcaaattgctgttttc-ttcttgtgatt-gatatgacttttagtatcttatgttgcctttaattattttgtttag
|||| || |||||||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||| |||||| | ||||||||| ||||   || ||  | ||  |  ||||  ||||  ||||||| ||   | || ||  |       |    | ||| |||  |          
AAACCGTCCCTGTTAGAACTGTCAACCGCCAGTGTTCATCTGGGCTACAGGCAGTAGCTGATGTCGCAGCTGCTATAAAGGCTGGTTACTATGACATAGgtacttagtatctgaatatacatgctactttcgctcttgtgctttagtttggctgctgaatcgctgctctccctctaaacag---------

upper sequence: GLYMA10G24590.3 (Glycine max), 5'ss of exon 5
lower sequence: AT2G33150.1 (Arabidopsis thaliana), 5'ss of exon 5
AAACTGTGCCTGTTAGGACCGTTAATAGGCAATGTTCATCTGGGCTCCAGGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTGgtaaaggatgcatcaaattgctgttttcttcttgtgattgatatgacttttagt--atcttatgttgcctttaattattttgtttag
|||| ||| |||| || || || ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |  || || || |||||||||||| |  ||   | |   ||    |   |  | | |  || |||        ||   |   |||| ||  |  |              
AAACCGTGGCTGTCAGAACTGTGAATAGACAGTGCTCATCTGGGCTTCAGGCTGTTGCTGATGTAGCCGCTGCCATTAAAGCGGGATTTTATGACATTGgttagtgaataaccgtctttaactacgccacatttt-ttcatagagaaccgagctgacgatatgatggatgcag-------------

upper sequence: GLYMA10G24590.3 (Glycine max), 5'ss of exon 5
lower sequence: AT1G04710.1 (Arabidopsis thaliana), 5'ss of exon 5
AAACTGTGCCTGTTAGGACCGTTAATAGGCAATGTTCATCTGGGCTCCAGGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTGgtaaaggatgcatcaaattgctgttttcttct-tgtgattgatatgacttttagtatcttatgttgc-ctttaattattttgtttag--
||||||| ||  | || ||||| || || || |||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||||||||||||  |||      | |  || | ||    |   | | |  | | | | || | ||      |||  ||  |||||  |||  ||   
AAACTGTTCCCATCAGAACCGTGAACAGACAGTGTTCATCTGGGCTTCAGGCTGTTGCTGATGTTGCCGCTGCCATAAAAGCTGGTTTTTATGACATTGgtaa--gat------agtaactatctttggttacataaattgtctta-tcttggcatgaagaattgagctgaaattacgttgaatacag

upper sequence: GLYMA10G24590.3 (Glycine max), 5'ss of exon 5
lower sequence: Vv05s0051g00720.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 5
AAACTGTGCCTGTTAGGACCGTTAATAGGCAATGTTCATCTGGGCTCCAGGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTGgtaaaggatgcat-caaattgctgttttcttcttgtgattgatatgacttttagtatcttatgttgcctttaattattttgtttag
||||||||||||| || || || || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||| | ||| |   |  || | |     | |      |  |||||      |  ||    |   |  |   ||  |  |||||||
AAACTGTGCCTGTCAGAACTGTGAACAGGCAATGTTCATCTGGTCTTCAGGCAGTTGCTGATGTAGCTGCTGCAATTAAAGCTGGGTTTTATGACATTGgtaa-gaatgtacatattttaccgaggagtcccatacttctatatg-tgaacaaaatacattaaagtttaatatcttcctgtttag

upper sequence: GLYMA10G24590.3 (Glycine max), 5'ss of exon 5
lower sequence: EFJ35624 (Selaginella moellendorffii), 5'ss of exon 5
AAACTGTGCCTGTTAGGACCGTTAATAGGCAATGTTCATCTGGGCTCCAGGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTGgtaaaggatgcatcaaattgctgttttcttcttgtgattgatatgacttttagtatcttatgttgcctttaattattttgtttag
|||||||||||||| | ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |  |||||||| | ||| || |||||||| |||||| |   |    |   |   |     |   ||| |||   |  |    || ||                                
AAACTGTGCCTGTTCGTACCGTGAACAGGCAATGTTCTTCTGGCCTCCAAGCAGTAGCTGATGTTGTGGCTGCTATCAAGGCCGGATTCTATGATATTGgtgagtcagaattattacacccacggttcgcttatgaaaaacgta---ttcag--------------------------------

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|254346509|gb|GR856231.1|GR856231
EST:     GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTG                         GTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
genomic: GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTGgtaaaggatg ... ttttgtttagGTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
EST: gi|14205951|gb|BG839629.1|BG839629
EST:     GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTG                         GNATTGGTGCCCGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCCATGGGATGGGATG
genomic: GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTGgtaaaggatg ... ttttgtttagGTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
EST: gi|12772777|gb|BG237704.1|BG237704
EST:     GCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATGTG                         GTATTGGTGCCAGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGA
genomic: GCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACAT-TGgtaaaggatg ... ttttgtttagGTATTGGTGCC-GGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGA
EST: gi|8284713|gb|BE022255.1|BE022255
EST:     GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTG                         GTATTGGGTGCCGGTT-GGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGA
genomic: GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTGgtaaaggatg ... ttttgtttagGTATTGG-TGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGA
EST: gi|120495133|gb|EH223300.1|EH223300
EST:     GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTG                         GTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
genomic: GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTGgtaaaggatg ... ttttgtttagGTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
EST: gi|15813513|gb|BI785788.1|BI785788
EST:     GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTG                         GGATTGGTGCCGGTTTGGGATCTATGACCACTAATCCCATGGGATGGGATG
genomic: GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTGgtaaaggatg ... ttttgtttagGTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
EST: gi|7692636|gb|AW760738.1|AW760738
EST:     GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTG                         GTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
genomic: GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTGgtaaaggatg ... ttttgtttagGTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
EST: gi|10709746|gb|BF009470.1|BF009470
EST:     GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTG                         GTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
genomic: GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTGgtaaaggatg ... ttttgtttagGTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
EST: gi|7693433|gb|AW761525.1|AW761525
EST:     GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTG                         GTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATACAATGGGATGGGATG
genomic: GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTGgtaaaggatg ... ttttgtttagGTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
EST: gi|7691642|gb|AW759765.1|AW759765
EST:     GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTG                         GTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
genomic: GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTGgtaaaggatg ... ttttgtttagGTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
EST: gi|37996297|gb|CF807886.1|CF807886
EST:     GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTG                         GTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
genomic: GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTGgtaaaggatg ... ttttgtttagGTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
EST: gi|254317034|gb|GR828571.1|GR828571
EST:     GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTG                         GTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
genomic: GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTGgtaaaggatg ... ttttgtttagGTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
EST: gi|19347292|gb|BM892172.1|BM892172
EST:     GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTG                         GTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
genomic: GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTGgtaaaggatg ... ttttgtttagGTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
EST: gi|6482895|gb|AW202105.1|AW202105
EST:     GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTG                         GTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
genomic: GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTGgtaaaggatg ... ttttgtttagGTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
EST: gi|254333126|gb|GR850376.1|GR850376
EST:     GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTG                         GTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
genomic: GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTGgtaaaggatg ... ttttgtttagGTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
EST: gi|213614820|gb|DB956956.1|DB956956
EST:     GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTG                         GTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
genomic: GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTGgtaaaggatg ... ttttgtttagGTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
EST: gi|192298166|gb|FG992031.1|FG992031
EST:     GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTG                         GTATTGGTGTCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
genomic: GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTGgtaaaggatg ... ttttgtttagGTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
EST: gi|27425491|gb|CA937011.1|CA937011
EST:     GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTG                         GTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
genomic: GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTGgtaaaggatg ... ttttgtttagGTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
EST: gi|6566270|gb|AW233949.1|AW233949
EST:     GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTG                         GTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
genomic: GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTGgtaaaggatg ... ttttgtttagGTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
EST: gi|26268999|gb|CA820062.1|CA820062
EST:     GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTG                         GTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
genomic: GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTGgtaaaggatg ... ttttgtttagGTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
EST: gi|18041099|gb|BM309393.1|BM309393
EST:     GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTG                         GTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
genomic: GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTGgtaaaggatg ... ttttgtttagGTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
EST: gi|254331508|gb|GR843465.1|GR843465
EST:     GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTG                         GTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
genomic: GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTGgtaaaggatg ... ttttgtttagGTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
EST: gi|209726647|gb|BW666565.1|BW666565
EST:     GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTG                         GTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTA
genomic: GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTGgtaaaggatg ... ttttgtttagGTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTA
EST: gi|209698441|gb|BW667238.1|BW667238
EST:     GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTG                         GTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCA
genomic: GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTGgtaaaggatg ... ttttgtttagGTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCA
EST: gi|192296295|gb|FG991577.1|FG991577
EST:     GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTG                         GTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
genomic: GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTGgtaaaggatg ... ttttgtttagGTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
EST: gi|15202571|gb|BI425470.1|BI425470
EST:     GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTG                         GTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCAAATGGGATGGGATG
genomic: GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTGgtaaaggatg ... ttttgtttagGTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
EST: gi|7692466|gb|AW760572.1|AW760572
EST:     GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTG                         GTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
genomic: GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTGgtaaaggatg ... ttttgtttagGTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
EST: gi|120534371|gb|EH262504.1|EH262504
EST:     GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTG                         GTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
genomic: GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTGgtaaaggatg ... ttttgtttagGTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
EST: gi|209725233|gb|BW672708.1|BW672708
EST:     GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTG                         GTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCA
genomic: GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTGgtaaaggatg ... ttttgtttagGTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCA
EST: gi|192325989|gb|FK016186.1|FK016186
EST:     GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTG                         GTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG
genomic: GGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTGgtaaaggatg ... ttttgtttagGTATTGGTGCCGGTTTGGAATCTATGACCACTAATCCAATGGGATGGGATG

Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
AAACTGTGCCTGTTAGGACCGTTAATAGGCAATGTTCATCTGGGCTCCAGGCTGTCGCTGATGTAGCTGCTGCTATAAGGGCTGGGTTCTATGACATTGgtaaaggatgcatcaaattgctgttttcttcttgtgattgatatgacttttagtatcttatgttgcctttaattattttgtttag

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGAT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGCTGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GCTGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  TGCTGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGCT