Mapped EST sequences
Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments
ATGC EST sequence
ATGC genomic sequence (exon)
ATGC genomic sequence (truncated intron)
EST:
gi|22929557|gb|BU546696.1|BU546696EST: GCCAGATTATGTCACAATTGCAGGCCCCTCCTTCATCCTAACTGGCCCAG GAACTAGGAAGCATGGATGCAGGATGCTCCTAGTGATAATGCAGCTGCTGA
genomic: GCCAGATTATGTCACAATTGCAGGCCCCTCCTTCATCCTAACTGGCCCAGgtaagactat ... ttggttgtagGAACTAGGAAGCATGGATGCAGGATGCTCCTAGTGATAATGCAGCTGCTGA
EST:
gi|208207523|gb|GE005064.1|GE005064EST: GCCAGATTATGTCACAATTGCAGGCCCCTCCTTCATCCTAACTGGCCCAG GAACTAGGAAGCATGGATGCAGGATGCTCCTAGTGATAATGCAGCTGCTGA
genomic: GCCAGATTATGTCACAATTGCAGGCCCCTCCTTCATCCTAACTGGCCCAGgtaagactat ... ttggttgtagGAACTAGGAAGCATGGATGCAGGATGCTCCTAGTGATAATGCAGCTGCTGA
EST:
gi|193634447|gb|FK580218.1|FK580218EST: GCCAGATTATGTCACAATTGCAGGCCCCTCCTTCATCCTAACTGGCCCAG GAACTAGGAAGCATGGATGCAGGATGCTCCTAGTGATAATGCAGCTG
genomic: GCCAGATTATGTCACAATTGCAGGCCCCTCCTTCATCCTAACTGGCCCAGgtaagactat ... ttggttgtagGAACTAGGAAGCATGGATGCAGGATGCTCCTAGTGATAATGCAGCTG
EST:
gi|207700867|gb|GD682756.1|GD682756EST: GCCAGATTATGTCACAATTGCAGGCCCCTCCTTCATCCTAACTGGCCCAG GAACTAGGAAGCATGGATGCAGGATGCTCCTAGTGATAATGCAGCTGCTGA
genomic: GCCAGATTATGTCACAATTGCAGGCCCCTCCTTCATCCTAACTGGCCCAGgtaagactat ... ttggttgtagGAACTAGGAAGCATGGATGCAGGATGCTCCTAGTGATAATGCAGCTGCTGA
EST:
gi|11688981|gb|BF596587.1|BF596587EST: GCCAGATTATGTCACAATTGCAGGCCCCTCCTTCATCCTAACTGGCCCAG GAACTAGGAAGCATGGATGCAGGATGCTCCTAGTGATAATGCAGCTGCTGA
genomic: GCCAGATTATGTCACAATTGCAGGCCCCTCCTTCATCCTAACTGGCCCAGgtaagactat ... ttggttgtagGAACTAGGAAGCATGGATGCAGGATGCTCCTAGTGATAATGCAGCTGCTGA
EST:
gi|193553760|gb|FK506295.1|FK506295EST: GCCAGATTATGTCACAATTGCAGGCCCCTCCTTCATCCTAACTGGCCCAG GAACTAGGAAGCATGGATGCAGGATGCTCCTAGTGATAATGCAGCTGCTGA
genomic: GCCAGATTATGTCACAATTGCAGGCCCCTCCTTCATCCTAACTGGCCCAGgtaagactat ... ttggttgtagGAACTAGGAAGCATGGATGCAGGATGCTCCTAGTGATAATGCAGCTGCTGA
EST:
gi|208326854|gb|GE118982.1|GE118982EST: GTCACAATTGCAGGCCCCTCCTTCATCCTAACTGGCCCAG GAACTAGGAAGCATGGATGCAGGATGCTCCTAGTGATAATGCAGCTGCTGA
genomic: GTCACAATTGCAGGCCCCTCCTTCATCCTAACTGGCCCAGgtaagactat ... ttggttgtagGAACTAGGAAGCATGGATGCAGGATGCTCCTAGTGATAATGCAGCTGCTGA
atgc intronic sequence ATGC exonic sequenceIntronic sequence truncated to 55 bases.tttgtcagggcagccattcatatttgtatttaatttgctaatattttggttgtagGAACTAGGAAGCATGGATGCAGGATGCTCCTAGTGATAATGCAGCTGCTGAAGCAACTCCTAATGTTGTTAGAAAGACAATTTACAAAGGATCTACTACA
tgctaat putative branch site (score: 2)
attcatatttgtattt TA-rich tract