Mapped EST sequences
Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments
ATGC EST sequence
ATGC genomic sequence (exon)
ATGC genomic sequence (truncated intron)
EST:
gi|23730759|gb|BU763481.1|BU763481EST: AGGTGGTCATGCTACATTTTATGGTGGGGGTGATGCATCTGGCACAATGG GAGGGGCTTGTGGTTATGGAAATTTGTACAGCCAAGGCTATGGAACCAACA
genomic: AGGTGGTCATGCTACATTTTATGGTGGGGGTGATGCATCTGGCACAATGGgtaagttcat ... ttttttacagGAGGGGCTTGTGGTTATGGAAATTTGTACAGCCAAGGCTATGGAACCAACA
EST:
gi|120530414|gb|EH258547.1|EH258547EST: TGATGCGTCTGGCACAATGG GAGGGGCTTGTGGTTATGGAAATTTGTACAGCCAAGGCTATGGAACCAACA
genomic: TGATGCATCTGGCACAATGGgtaagttcat ... ttttttacagGAGGGGCTTGTGGTTATGGAAATTTGTACAGCCAAGGCTATGGAACCAACA
EST:
gi|10845309|gb|BF068456.1|BF068456EST: AGGTGGTCATGCTACATTTTATGGTGGGG-TGATGCATCTGGCACAATGG GAGGGGCTTGTGGTTATGGAAATTTGTACAGCCAAGGCTATGGAACCAACA
genomic: AGGTGGTCATGCTACATTTTATGGTGGGGGTGATGCATCTGGCACAATGGgtaagttcat ... ttttttacagGAGGGGCTTGTGGTTATGGAAATTTGTACAGCCAAGGCTATGGAACCAACA
EST:
gi|20449736|gb|BQ253852.1|BQ253852EST: AGGTGGTCATGCTACATTTTATGGTGGGGGTGATGCATCTGGCACAATGG GAGGGGCTTGTGGTTATGGAAATTTGTACAGCCAAGGCTATGGAACCAACA
genomic: AGGTGGTCATGCTACATTTTATGGTGGGGGTGATGCATCTGGCACAATGGgtaagttcat ... ttttttacagGAGGGGCTTGTGGTTATGGAAATTTGTACAGCCAAGGCTATGGAACCAACA
EST:
gi|20815125|gb|BQ299603.1|BQ299603EST: GGTGGTCATGCTACATTTTATGGTGAGGGGTGATGCATCTGGCACAATGG GAGGGGCTTGTGGTTATGGAAATTTGTACAGCCAAGGCTATGGAACCAACA
genomic: GGTGGTCATGCTACATTTTATGGTG-GGGGTGATGCATCTGGCACAATGGgtaagttcat ... ttttttacagGAGGGGCTTGTGGTTATGGAAATTTGTACAGCCAAGGCTATGGAACCAACA
Putative cis-regulatory sequences
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
| | ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|
CTTAATTTATGCCTAAGAGGCACTTATGCTGACTATGGAGGTGGATGGCAAGGTGGTCATGCTACATTTTATGGTGGGGGTGATGCATCTGGCACAATGGgtaagttcattcaaagtgttacatttttagagtatttcaaaaggttttagtttcacattacctaattttgctaagtttatttttcaacatgataattaca
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGTGG