1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
TTCTTCGTCACGCTCGCGCCCACACCATGGCTTGACGGCAAGCATACAATCTTTGgtgagtgacggtgcctcctgggacatgcgccggtggacagcacatgagccgatgagctttagcactgcagtgccccttcacactcacacactgcgtggta...
species | Chlamydomonas reinhardtii |
transcript | EDO96957 |
intron # | 5 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: AGTCACGCTCGCGCCCACACCATGGCTTGACGGCAAGCATACAATCTTTG NGCGCGTCACCTCGGGCATGGCCGTCATCAAGCGGCTGGGTAACGTTCAGA
genomic: CGTCACGCTCGCGCCCACACCATGGCTTGACGGCAAGCATACAATCTTTGgtgagtgacg ... tgcctcacagGGCGCGTCACCTCGGGCATGGCCGTCATCAAGCGGCTGGGTAACGTTCAGA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TTCTTCGTCACGCTCGCGCCCACACCATGGCTTGACGGCAAGCATACAATCTTTGgtgagtgacggtgcctcctgggacatgcgccggtggacagcacatgagccgatgagctttagcactgcagtgccccttcacactcacacactgcgtggta
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -ggtgcct
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - agcacat
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - tgagctt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ttcacac
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -tcacaca
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -tgcgtgg