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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtaagattgggatgctgcagctgcgcgcatggaaatgcacccagagctcggtgcagcggctaccttgtgcctactcaccctgccgcctgacctgatgctatactgcggtgtgccggctcatgtgttggttcgcagCTGGTGCAGCAGAGCGGCGCCCAATGGCTGGCAGACGGTGTTTCCTTTGTCGATCAGGACCCGGGCCAGTTTCTCATCAAGTCAG

Basic information

species Chlamydomonas reinhardtii
transcript EDO96346
intron # 11
splice site 3'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|49470552|gb|BP098413.1|BP098413
EST:     GATTTTGGAACGCGCATCTACTCAATGACCAAG                         CTGGTGCAGCAGAGCGGCGCCCAATGGCTGGCAGACGGTGTTTCCTTTGTC
genomic: GATTTTGGAACGCGCATCTACTCAATGACCAAGgtaagattgg ... tggttcgcagCTGGTGCAGCAGAGCGGCGCCCAATGGCTGGCAGACGGTGTTTCCTTTGTC
EST: gi|10793033|gb|AV630399.1|AV630399
EST:     GATTTTGGAACGCGCATCTACTCAATGACCAAG                         CTGGTGCAGCAGAGCGGCGCCCAATGGCTGGCAGACGGTGTTTCCTTTGTC
genomic: GATTTTGGAACGCGCATCTACTCAATGACCAAGgtaagattgg ... tggttcgcagCTGGTGCAGCAGAGCGGCGCCCAATGGCTGGCAGACGGTGTTTCCTTTGTC