Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtgagtattcttgacctatatatgtttgatttggtatccatagttttcgttagatcatgtcctgagttagtttgtggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTTGCTCTTAAGGCTTTGGGGCTACCGAATGCTATTGACGGAACTCTCGTTG

Basic information

species Arabidopsis thaliana
transcript AT5G54770.1
intron # 2
splice site 3'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|125234576|gb|EL248661.1|EL248661
EST:     TGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: TGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|125248440|gb|EL262525.1|EL262525
EST:     AGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: AGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|125287315|gb|EL301400.1|EL301400
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGG
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGG
EST: gi|124727216|gb|EH818618.1|EH818618
EST:     TTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: TTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|124966296|gb|EL040409.1|EL040409
EST:     CGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: CGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|124934859|gb|EL011892.1|EL011892
EST:     CACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: CACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|124930199|gb|EL007673.1|EL007673
EST:     ATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: ATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|124847660|gb|EH932097.1|EH932097
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGA
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGA
EST: gi|125157288|gb|EL186466.1|EL186466
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAA
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAA
EST: gi|116478216|gb|EG520808.1|EG520808
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|125262715|gb|EL276800.1|EL276800
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTG
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTG
EST: gi|125307525|gb|EL321610.1|EL321610
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAAGGCGGTGACAA
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAA-GGCGG-GACAA
EST: gi|125321109|gb|EL335194.1|EL335194
EST:     TTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGA
genomic: TTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGA
EST: gi|164148477|gb|ES176701.1|ES176701
EST:     ATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAAC
genomic: ATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAAC
EST: gi|124726190|gb|EH817592.1|EH817592
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTA
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTA
EST: gi|125030134|gb|EL102403.1|EL102403
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGA
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGA
EST: gi|125298953|gb|EL313038.1|EL313038
EST:     GGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGG
genomic: GGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGG
EST: gi|125251581|gb|EL265666.1|EL265666
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGG
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGG
EST: gi|125193052|gb|EL208006.1|EL208006
EST:     TTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: TTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|124724283|gb|EH815685.1|EH815685
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGG
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGG
EST: gi|125200966|gb|EL215920.1|EL215920
EST:     TTGTTACCGGTATGGAAGTTACTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: TTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|124709903|gb|EH801305.1|EH801305
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAA
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAA
EST: gi|124763290|gb|EH853420.1|EH853420
EST:     AAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: AAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|125042172|gb|EL114441.1|EL114441
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGG
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGG
EST: gi|125123199|gb|EL169648.1|EL169648
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGG
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGG
EST: gi|124775875|gb|EH866002.1|EH866002
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAG
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAG
EST: gi|124806303|gb|EH893208.1|EH893208
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGG
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGG
EST: gi|124724433|gb|EH815835.1|EH815835
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGG
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGG
EST: gi|125273172|gb|EL287257.1|EL287257
EST:     GGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTTGCTATGATGATATCGGGACAAAAAGGCGGGACAAC
genomic: GGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGG-TGCTATGATGATATCGGGAC-AAAAGGCGGGACAAC
EST: gi|124758973|gb|EH849103.1|EH849103
EST:     GGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: GGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|125292006|gb|EL306091.1|EL306091
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACA
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACA
EST: gi|125324434|gb|EL338514.1|EL338514
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGG
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGG
EST: gi|124842166|gb|EH926603.1|EH926603
EST:     CACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: CACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|124920033|gb|EH993771.1|EH993771
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGA
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGA
EST: gi|125068251|gb|EL134461.1|EL134461
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTG
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTG
EST: gi|124801816|gb|EH891051.1|EH891051
EST:     TCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: TCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|124899819|gb|EH974437.1|EH974437
EST:     GATTTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGA
genomic: GA-TTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGA
EST: gi|124828930|gb|EH913766.1|EH913766
EST:     ACCGAGTAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACT
genomic: ACCGAG-AATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACT
EST: gi|124838392|gb|EH922831.1|EH922831
EST:     AAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: AAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|124729776|gb|EH821178.1|EH821178
EST:     ATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: ATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|124771182|gb|EH861312.1|EH861312
EST:     TGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGAACAAAAGGCGGGACAACT
genomic: TGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGA-CAAAAGGCGGGACAACT
EST: gi|125245569|gb|EL259654.1|EL259654
EST:     TGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: TGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|125064756|gb|EL132269.1|EL132269
EST:     CGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACGT
genomic: CGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|125127006|gb|EL172073.1|EL172073
EST:     CTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: CTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|125186123|gb|EL201077.1|EL201077
EST:     CACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: CACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|124811653|gb|EH896519.1|EH896519
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGG
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGG
EST: gi|125277126|gb|EL291211.1|EL291211
EST:     GATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGAATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGG
genomic: GATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGA-TGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGG
EST: gi|125069904|gb|EL135513.1|EL135513
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGACTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGAC
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTG-CTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGAC
EST: gi|125204669|gb|EL219623.1|EL219623
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGA
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGA
EST: gi|125246154|gb|EL260239.1|EL260239
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTG
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTG
EST: gi|124704675|gb|EH796077.1|EH796077
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         G-ACCAACTTTTGGT
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGT
EST: gi|125309925|gb|EL324010.1|EL324010
EST:     TCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACT
genomic: TCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAAC-TTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACT
EST: gi|124760820|gb|EH850950.1|EH850950
EST:     TGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: TGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|125274062|gb|EL288147.1|EL288147
EST:     TGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: TGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|125161552|gb|EL188623.1|EL188623
EST:     TTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAAGGCGGGACAACT
genomic: TTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAA-GGCGGGACAACT
EST: gi|125242885|gb|EL256970.1|EL256970
EST:     ATCGATAGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: ATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|94331543|gb|AM111272.1|AM111272
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAAAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|164210572|gb|ES049896.1|ES049896
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGA
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGA
EST: gi|124974898|gb|EL048430.1|EL048430
EST:     GAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGA
genomic: GAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGA
EST: gi|116420535|gb|EG463127.1|EG463127
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTCGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|124823773|gb|EH908639.1|EH908639
EST:     CACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: CACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|124935918|gb|EL012865.1|EL012865
EST:     GTATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGA
genomic: G-ATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGA
EST: gi|125255583|gb|EL269668.1|EL269668
EST:     TTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: TTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|125050951|gb|EL123220.1|EL123220
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTG
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTG
EST: gi|116406225|gb|EG448817.1|EG448817
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|116406224|gb|EG448816.1|EG448816
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|125253595|gb|EL267680.1|EL267680
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAAACTTTTGGTGCTATGA
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAA-CTTTTGGTGCTATGA
EST: gi|124843273|gb|EH927710.1|EH927710
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATA
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATA
EST: gi|124862567|gb|EH947004.1|EH947004
EST:     CGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: CGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|125022845|gb|EL095114.1|EL095114
EST:     TGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: TGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|116478219|gb|EG520811.1|EG520811
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|124921896|gb|EL000238.1|EL000238
EST:     TTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCG
genomic: TTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCG
EST: gi|124863177|gb|EH947614.1|EH947614
EST:     TGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: TGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|124883721|gb|EH962623.1|EH962623
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAA
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAA
EST: gi|124930598|gb|EL008032.1|EL008032
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATG
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATG
EST: gi|124829511|gb|EH914102.1|EH914102
EST:     CCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: CCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|124707611|gb|EH799013.1|EH799013
EST:     CCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: CCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|124869626|gb|EH954063.1|EH954063
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATG
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATG
EST: gi|125106224|gb|EL159759.1|EL159759
EST:     ACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGANGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: ACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|125062127|gb|EL130591.1|EL130591
EST:     TGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTACGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: TGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|124836279|gb|EH920718.1|EH920718
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCT
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCT
EST: gi|124840632|gb|EH925071.1|EH925071
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATAAGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAAC
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTAT--GATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAAC
EST: gi|125282388|gb|EL296473.1|EL296473
EST:     GATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAAGGCGGGACAACT
genomic: GATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGAC-AAAAGGCGGGACAACT
EST: gi|124964607|gb|EL038857.1|EL038857
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGA
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGA
EST: gi|125126340|gb|EL171575.1|EL171575
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCTAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACT
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACC-AACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACT
EST: gi|124993105|gb|EL065374.1|EL065374
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAA
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAA
EST: gi|125152397|gb|EL184057.1|EL184057
EST:     GATTGTTACCGGTATGGAAGTTGTCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGA
genomic: GATTGTTACCGGTATGGAAGTTG-CTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGA
EST: gi|124929486|gb|EL007026.1|EL007026
EST:     AGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: AGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|163980502|gb|EL982762.1|EL982762
EST:     GAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGAC
genomic: GAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGAC
EST: gi|124977635|gb|EL050940.1|EL050940
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAAACTTTTGGTG
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAA-CTTTTGGTG
EST: gi|125204192|gb|EL219146.1|EL219146
EST:     CACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: CACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|124736459|gb|EH827861.1|EH827861
EST:     TGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACTAACT
genomic: TGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGAC-AACT
EST: gi|47831345|gb|CK121029.1|CK121029
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|124905711|gb|EH979791.1|EH979791
EST:     TTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGTATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: TTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCG-ATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|124803217|gb|EH891646.1|EH891646
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|125046203|gb|EL118472.1|EL118472
EST:     TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: TGATTGTTACCGGTATGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
EST: gi|124715151|gb|EH806553.1|EH806553
EST:     TGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATG                         GGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT
genomic: TGGAAGTTGCTGAGATCGATGGTGCACCGAGAATGgtgagtattc ... ggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTT


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

ttggtatccatagttttcgttagatcatgtcctgagttagtttgtggtgatgtagGGACCAACTTTTGGTGCTATGATGATATCGGGACAAAAGGCGGGACAACTTGCTCTTAAGGCTTTGGGGCTACCGAATGCTATTGACGGAACTCTCGTTG
         atagtttt  TA-rich tract