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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TGAGATCAGTAAGAACCCTAATGTTCAAGTTGCCATTATTGAGCAATCTGTTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagatttagattcatttgcatgtgtgattttgttgaagttttgagttctgtttctgttttaatggagaattagggtttagattgaatcattatgagtattgattgcttgtgcttatggtag

Basic information

species Arabidopsis thaliana
transcript AT5G54770.1
intron # 1
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|47827886|gb|CK117570.1|CK117570
EST:     TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
genomic: TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
EST: gi|125091169|gb|EL148992.1|EL148992
EST:     GGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
genomic: GGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
EST: gi|47831870|gb|CK121554.1|CK121554
EST:     TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
genomic: TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
EST: gi|125243721|gb|EL257806.1|EL257806
EST:     TAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTTCAGCTCTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
genomic: TAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGG-TCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
EST: gi|125048797|gb|EL121066.1|EL121066
EST:     GGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
genomic: GGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
EST: gi|125193170|gb|EL208124.1|EL208124
EST:     CCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTAGACGAGATTGGTGTGGCTTA
genomic: CCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTT-GACGAGATTGGTGTGGCTTA
EST: gi|125207455|gb|EL222409.1|EL222409
EST:     TCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
genomic: TCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
EST: gi|125212219|gb|EL227173.1|EL227173
EST:     TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCA
genomic: TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCA
EST: gi|47829578|gb|CK119262.1|CK119262
EST:     TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
genomic: TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
EST: gi|125054872|gb|EL125367.1|EL125367
EST:     TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCT
genomic: TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCT
EST: gi|124922378|gb|EL000671.1|EL000671
EST:     CGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
genomic: CGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
EST: gi|124910522|gb|EH984602.1|EH984602
EST:     CGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
genomic: CGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
EST: gi|125134198|gb|EL175243.1|EL175243
EST:     TAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCA
genomic: TAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCA
EST: gi|125176465|gb|EL195766.1|EL195766
EST:     TCGGTGGTCAGCTTTTCTTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTA
genomic: TCGGTGGTCAGCTTTTC-TCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTA
EST: gi|124974977|gb|EL048503.1|EL048503
EST:     TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACG
genomic: TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACG
EST: gi|47829962|gb|CK119646.1|CK119646
EST:     TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
genomic: TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
EST: gi|125054234|gb|EL125034.1|EL125034
EST:     TGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
genomic: TGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
EST: gi|124911354|gb|EH985434.1|EH985434
EST:     TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTT
genomic: TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTT
EST: gi|125163822|gb|EL190592.1|EL190592
EST:     TCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTACCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTA
genomic: TCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTT-CCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTA
EST: gi|125103957|gb|EL158174.1|EL158174
EST:     TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTT
genomic: TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTT
EST: gi|125274407|gb|EL288492.1|EL288492
EST:     AGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGACTTTTACTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAG
genomic: AGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAG-CTTTT-CTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAG
EST: gi|124880671|gb|EH959573.1|EH959573
EST:     TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGG
genomic: TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGG
EST: gi|125292927|gb|EL307012.1|EL307012
EST:     TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTG
genomic: TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTG
EST: gi|125019965|gb|EL092234.1|EL092234
EST:     TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGG
genomic: TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGG
EST: gi|116429816|gb|EG472408.1|EG472408
EST:     TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
genomic: TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
EST: gi|124870064|gb|EH954501.1|EH954501
EST:     CTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
genomic: CTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
EST: gi|125245325|gb|EL259410.1|EL259410
EST:     CTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
genomic: CTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
EST: gi|125201650|gb|EL216604.1|EL216604
EST:     TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCA
genomic: TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCA
EST: gi|124832912|gb|EH917351.1|EH917351
EST:     CTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTAGACGAGATTGGTGTGGCTT
genomic: CTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTC-TCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTT-GACGAGATTGGTGTGGCTT
EST: gi|125308145|gb|EL322230.1|EL322230
EST:     TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCAACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTA
genomic: TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCA-CTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTA
EST: gi|125292753|gb|EL306838.1|EL306838
EST:     TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGAC
genomic: TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGAC
EST: gi|124877421|gb|EH956858.1|EH956858
EST:     AGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTTTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
genomic: AGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGG--TCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
EST: gi|47828647|gb|CK118331.1|CK118331
EST:     TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
genomic: TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
EST: gi|124748198|gb|EH838328.1|EH838328
EST:     TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
genomic: TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
EST: gi|124904188|gb|EH978268.1|EH978268
EST:     TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTCGTTC
genomic: TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTC
EST: gi|124903338|gb|EH977418.1|EH977418
EST:     TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
genomic: TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
EST: gi|124790932|gb|EH880611.1|EH880611
EST:     CTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
genomic: CTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
EST: gi|125079005|gb|EL141177.1|EL141177
EST:     CTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
genomic: CTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
EST: gi|125192120|gb|EL207074.1|EL207074
EST:     TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAG
genomic: TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAG
EST: gi|124728506|gb|EH819908.1|EH819908
EST:     TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAG
genomic: TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAG
EST: gi|125030844|gb|EL103113.1|EL103113
EST:     TAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGACCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCAC
genomic: TAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCG-CCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCAC
EST: gi|124726379|gb|EH817781.1|EH817781
EST:     CGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
genomic: CGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
EST: gi|125313051|gb|EL327136.1|EL327136
EST:     TTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
genomic: TTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
EST: gi|124948786|gb|EL024496.1|EL024496
EST:     CGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
genomic: CGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
EST: gi|124780675|gb|EH870618.1|EH870618
EST:     TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGACAAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATT
genomic: TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCG-CAAA-CCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATT
EST: gi|124931405|gb|EL008765.1|EL008765
EST:     TAGTCCTTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTT
genomic: TAGTCC-TGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTT
EST: gi|124909093|gb|EH983173.1|EH983173
EST:     CTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
genomic: CTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
EST: gi|125315478|gb|EL329563.1|EL329563
EST:     CGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
genomic: CGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
EST: gi|125216648|gb|EL230731.1|EL230731
EST:     CTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
genomic: CTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
EST: gi|125295468|gb|EL309553.1|EL309553
EST:     AGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
genomic: AGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
EST: gi|125063544|gb|EL131485.1|EL131485
EST:     CGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
genomic: CGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
EST: gi|47832009|gb|CK121693.1|CK121693
EST:     TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
genomic: TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTAC
EST: gi|125077218|gb|EL140086.1|EL140086
EST:     TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATG                         ATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTT
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genomic: TCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagA-TTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGAGATTGGTGTGGCTTA
EST: gi|125206559|gb|EL221513.1|EL221513
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genomic: TTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagattta ... cttatggtagATTGTTCGCAAACCAGCTCACTTGTTCCTTGACGA

Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
TGAGATCAGTAAGAACCCTAATGTTCAAGTTGCCATTATTGAGCAATCTGTTAGTCCTGGTGGTGGTGCTTGGCTCGGTGGTCAGCTTTTCTCCGCCATGgtaagatttagattcatttgcatgtgtgattttgttgaagttttgagttctgtttctgttttaatggagaattagggtttagattgaatcattatgagtattgattgcttgtgcttatggtag

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  TGGTGG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGTGG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  TCAGCT