1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
gtaacttcctcgttcctcatttcttaaattctcaatacattaatccgttgagcttagatttgtttagatacgttacttgtatcaatatggaactaaaaatccgttgaatttgatctttaggtctcgaaagtttcaatgtttagctgattttgtttcgatgaattcgaggattgatgtttttggcaatatgtgtttgcagATTTTGTATGTCCTAGTGAGGGTTATAATTTCGCATTCAAGTCATACCTGGAAAAATTGGATTGGTCTTGTGTTAACATCGTTAGGTTACGGGATTCCAT
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT4G30500.1 |
intron # | 1 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: AGAACGCTCGACACATGGCTAAGCTCCGTCTCATTATGATCCTTTGCAAC ATTTTGTATGTCCTAGTGAGGGTTATAATTTCGCATTCAAGTCATACCTGGEST: gi|86085401|gb|DR381160.1|DR381160
genomic: AGAACGCTCGACACATGGCTAAGCTCCGTCTCATTATGATCCTTTGCAACgtaacttcct ... gtgtttgcagATTTTGTATGTCCTAGTGAGGGTTATAATTTCGCATTCAAGTCATACCTGG
EST: ACGCTCGACACATGGCTAAGCTCCGTCTCATTATGATCC-TTGCAAC ATTTTGTATGYCCTAGTGAGGGTTATAATTTCGCATTCAAGTCATACCTGG
genomic: ACGCTCGACACATGGCTAAGCTCCGTCTCATTATGATCCTTTGCAACgtaacttcct ... gtgtttgcagATTTTGTATGTCCTAGTGAGGGTTATAATTTCGCATTCAAGTCATACCTGG
tgattttgtttcgatgaattcgaggattgatgtttttggcaatatgtgtttgcagATTTTGTATGTCCTAGTGAGGGTTATAATTTCGCATTCAAGTCATACCTGGAAAAATTGGATTGGTCTTGTGTTAACATCGTTAGGTTACGGGATTCCAT
gattgat putative branch site (score: 4)
atgttttt TA-rich tract