1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
gtgggttttgtataaaagactgaaatcgtgtaatttgattgagaacttcatggtttgatgctcagttttttttgtggtgtggtatggttcagTACCTTGTCCAAGTATGGAGTTCATGGGTTTCCTACTATCATCCTTATGAATTCGACAATGCTCGTAGTTTACCGGGGATCGAGAACTCTTGATTCCCTT
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT4G08930.1 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TATTCATCGGTTCCACACTTTGCAATTGAGGAATCATCAGTTAAAGCTAG TACCTTGTCCAAGTATGGAGTTCATGGGTTTCCTACTATCATCCTTATGAA
genomic: TATTCATCGGTTCCACACTTTGCAATTGAGGAATCATCAGTTAAAGCTAGgtgggttttg ... tatggttcagTACCTTGTCCAAGTATGGAGTTCATGGGTTTCCTACTATCATCCTTATGAA
attgagaacttcatggtttgatgctcagttttttttgtggtgtggtatggttcagTACCTTGTCCAAGTATGGAGTTCATGGGTTTCCTACTATCATCCTTATGAATTCGACAATGCTCGTAGTTTACCGGGGATCGAGAACTCTTGATTCCCTT
gtttgat putative branch site (score: 5)
agtttttttt TA-rich tract