1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
gtaatgaatcttatcgtttccattgatgtttcgtttatgtatataggctttgtttgatggtaaaggtgttgtctttatggaattttgtaacagGGTCTTCTTCTACTGGACTGATGGGTTCTGCTCCAGCTTCATACTCGAATCTTATAAATCAAACAATGCCAAACATGCCTAATTACACTGGTTCTGTTTC
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT3G23900.2 |
intron # | 1 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CAATGGGAATGCTATCATGGGAAGTCCCTTTCCTGTCTTCTTTAGCCAAG GGTCTTCTTCTACTGGACTGATGGGTTCTGCTCCAGCTTCATA
genomic: CAATGGGAATGCTATCATGGGAAGTCCCTTTCCTGTCTTCTTTAGCCAAGgtaatgaatc ... tttgtaacagGGTCTTCTTCTACTGGACTGATGGGTTCTGCTCCAGCTTCATA
gtatataggctttgtttgatggtaaaggtgttgtctttatggaattttgtaacagGGTCTTCTTCTACTGGACTGATGGGTTCTGCTCCAGCTTCATACTCGAATCTTATAAATCAAACAATGCCAAACATGCCTAATTACACTGGTTCTGTTTC
gtttgat putative branch site (score: 5)
aattttgtaa TA-rich tract