1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
gtcagtcatgtctttcatattttaaacatttggatttatgtttaatttttaattttttaatgttggtttacttcttttatttgtgtgtaaagTTTTCTTATGATATTGGATCAAACGAAATGGAAGTACTCAAACAATATAATGGCTTCACTATTAGCTCCTTACCTCTTCTCTAGCCTTCCTATTGTTATT
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT2G23680.1 |
intron # | 1 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CCAGTTATGATCACGTTGTTCCTAAGATGGCTCACGTCCATCGTTGCAGT TTTTCTTATGATATTGGATCAAACGAAATGGAAGTACTCAAACAATATAAT
genomic: CCAGTTATGATCACGTTGTTCCTAAGATGGCTCGCGTCCATCGTTGCAGTgtcagtcatg ... gtgtgtaaagTTTTCTTATGATATTGGATCAAACGAAATGGAAGTACTCAAACAATATAAT
atgtttaatttttaattttttaatgttggtttacttcttttatttgtgtgtaaagTTTTCTTATGATATTGGATCAAACGAAATGGAAGTACTCAAACAATATAATGGCTTCACTATTAGCTCCTTACCTCTTCTCTAGCCTTCCTATTGTTATT
ttttaat putative branch site (score: 3)
cttcttttatttgt putative PPT
taatttttaatttttt TA-rich tract