Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GAATGGCATTGTGTCAAATGGAGAAGCATCAAATGGAAAGAAGCCATTTACCACTATTGATGATGTTTTGATAGGATTGGTAAAATGGCTTTGTGATCAGgtatgtgatacaggaaattgtttctttctcactggatcaactgctaagagtaattcacagacatgtcaacaatcaacctaatcacatcaacttatggagg...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA16G25740.1
intron # 7
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|7685192|gb|AW755840.1|AW755840
EST:     CCACTATTGATGATGTTTTGATAGGATTGGTAAAATGGCTTTGTGATCAG                         TTGAAGAAACCTTCTCATCCTATTCGTGGAGTCCCGACTGCTATCAATTGC
genomic: CCACTATTGATGATGTTTTGATAGGATTGGTAAAATGGCTTTGTGATCAGgtatgtgata ... atatctgtagTTGAAGAAACCTTCTCATCCTATTCGTGGAGTCCCGACTGCTATCAATTGC
EST: gi|208029746|gb|GD829660.1|GD829660
EST:     CCACTATTGATGATGTTTTGATAGGATTGGCAAAATGGCTTTGTGATCAG                         TTGAAGAAACCTTCTCATCCTATTCGTGGAGTCCCGACTGCTATCAATTGC
genomic: CCACTATTGATGATGTTTTGATAGGATTGGTAAAATGGCTTTGTGATCAGgtatgtgata ... atatctgtagTTGAAGAAACCTTCTCATCCTATTCGTGGAGTCCCGACTGCTATCAATTGC
EST: gi|17518712|gb|BM187754.1|BM187754
EST:     CCACTATTGATGATGTTTTGATAGGATTGGTAAAATGGCTTTGTGATCAG                         TTGAAGAAACCTTCTCATCCTATTCGTGGAGTCCCGACTGCTATCAATTGC
genomic: CCACTATTGATGATGTTTTGATAGGATTGGTAAAATGGCTTTGTGATCAGgtatgtgata ... atatctgtagTTGAAGAAACCTTCTCATCCTATTCGTGGAGTCCCGACTGCTATCAATTGC
EST: gi|7925310|gb|AW831397.1|AW831397
EST:     CCACTATTGATGATGTTTTGATAGGATTGGTAAAATGGCTTTGTGATCAG                         TTGAAGAAACCTTCTCATCCTATTCGTGGAGTCCCGACTGCTATCAATTGC
genomic: CCACTATTGATGATGTTTTGATAGGATTGGTAAAATGGCTTTGTGATCAGgtatgtgata ... atatctgtagTTGAAGAAACCTTCTCATCCTATTCGTGGAGTCCCGACTGCTATCAATTGC
EST: gi|193728323|gb|FK665093.1|FK665093
EST:     CACTATTGATGATGTTTTGATAGGATTGGTAAAAATGGCTTTGTGATCAG                         TTGAAGAAACCTTCTCATCCTATTCGTGGAGTCCCGACTGCTATCAATTGC
genomic: CACTATTGATGATGTTTTGATAGGATTGGTAAAA-TGGCTTTGTGATCAGgtatgtgata ... atatctgtagTTGAAGAAACCTTCTCATCCTATTCGTGGAGTCCCGACTGCTATCAATTGC