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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GAATGGCGTTGTGTCTAATGGAGAAGCATCAAATGGAAAGAAGCCATTTACCACTATTGATGATGTTTTAATAGGATTGGTAAAATGGCTTTGTGAACAGgtatgtgatacatgaaattgtttctttctcactagatcaactgcgtaagagtaattcacagacttgtcaacaatgcacctaatcacatcaacttatggag...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA02G06710.1
intron # 7
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|7591516|gb|AW707247.1|AW707247
EST:     CCACTATTGATGATGTTTTAATAGGATTGGTAAAATGGCTTTGTGAACAG                         TTGAAGAAACCTTCTCATCCTATTCGTGGAGTCCCAACTGCTATCAATTGC
genomic: CCACTATTGATGATGTTTTAATAGGATTGGTAAAATGGCTTTGTGAACAGgtatgtgata ... atatctgtagTTGAAGAAACCTTCTCATCCTATTCGTGGAGTCCCAACTGCTATCAATTGC
EST: gi|11273796|gb|BF324191.1|BF324191
EST:     CCACTATTGATGATGTTTTAATAGGATTGGTAAAATGGCTTTGTGAACAG                         TTGAAGAAACCTTCTCATCCTATTCGTGGAGTCCCAACTGCTATCAATTGC
genomic: CCACTATTGATGATGTTTTAATAGGATTGGTAAAATGGCTTTGTGAACAGgtatgtgata ... atatctgtagTTGAAGAAACCTTCTCATCCTATTCGTGGAGTCCCAACTGCTATCAATTGC
EST: gi|9258429|gb|BE346576.1|BE346576
EST:     TATTGATGATGTTTTAATAGGATTGGTAAAATGGNTTTGTGAACAG                         TTGAAGAAACNTTCTCATCTTATTCGTGGAGTCCCAANTGCTATCAATTGC
genomic: TATTGATGATGTTTTAATAGGATTGGTAAAATGGCTTTGTGAACAGgtatgtgata ... atatctgtagTTGAAGAAACCTTCTCATCCTATTCGTGGAGTCCCAACTGCTATCAATTGC
EST: gi|5770507|gb|AI973681.1|AI973681
EST:     CCACTATTGATGATGTTTTAATAGGATTGGTAAAATGGCTTTGTGAACAG                         TTGAAGAAACCTTCTCATCCTATTCGTGGAGTCCCAACTGCTATCAATTGC
genomic: CCACTATTGATGATGTTTTAATAGGATTGGTAAAATGGCTTTGTGAACAGgtatgtgata ... atatctgtagTTGAAGAAACCTTCTCATCCTATTCGTGGAGTCCCAACTGCTATCAATTGC