Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTCTTTAATAAATGGTCCAACAAAAGCTTCAAGAAAGACTGGCTTCGGGAGGACTCCAAGTGTTCTTGTGCTTCTACCTACTAGGGAATTGGCCTGTCAGgtatgtacttctatgcatgagtattgtacctgtggatttcagggtgaatgtatcattctttttaatgaggagtgttttgtgcattag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA20G29060.1
intron # 2
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|207684889|gb|GD666206.1|GD666206
EST:     GGACTCCAAGTGTTCTTGTGCTTCTACCTACTAGGGAATTGGCCTGTCAG                         GTGCATGCTGATTTTGATGTTTATGGTGGGGCAATGGGATTGAGTTCATGT
genomic: GGACTCCAAGTGTTCTTGTGCTTCTACCTACTAGGGAATTGGCCTGTCAGgtatgtactt ... tgtgcattagGTGCATGCTGATTTTGATGTTTATGGTGGGGCAATGGGATTGAGTTCATGT
EST: gi|254316012|gb|GR825821.1|GR825821
EST:     GGACTCCAAGTGTTCTTGTGCTTCTACCTACTAGGGAATTGGCCTGTCAG                         GTGCATGCTGATTTTGATGTTTATGGTGGGGCAATGGGATTGAGTTCATGT
genomic: GGACTCCAAGTGTTCTTGTGCTTCTACCTACTAGGGAATTGGCCTGTCAGgtatgtactt ... tgtgcattagGTGCATGCTGATTTTGATGTTTATGGTGGGGCAATGGGATTGAGTTCATGT
EST: gi|208221359|gb|GE015961.1|GE015961
EST:     GGACTCCAAGTGTTCTTGTGCTTCTACCTACTAGGGAATTGGCCTGTCAG                         GTGCATGCTGATTTTGATGTTTATGGTGGGGCAATGGGATTGAGTTCATG
genomic: GGACTCCAAGTGTTCTTGTGCTTCTACCTACTAGGGAATTGGCCTGTCAGgtatgtactt ... tgtgcattagGTGCATGCTGATTTTGATGTTTATGGTGGGGCAATGGGATTGAGTTCATG
EST: gi|193316745|gb|FK279059.1|FK279059
EST:     GGACTCCAAGTGTTCTTGTGCTTCTACCTACTAGGGAATTGGCCTGTCAG                         GTGCATGCTGATTTTGATGTTTATGGTGGGGCAATGGGATTGAGTTCATGT
genomic: GGACTCCAAGTGTTCTTGTGCTTCTACCTACTAGGGAATTGGCCTGTCAGgtatgtactt ... tgtgcattagGTGCATGCTGATTTTGATGTTTATGGTGGGGCAATGGGATTGAGTTCATGT