1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' |
CTTGCTGAAGCTGTTTATGAATACGGGAAAGGAAACTACGAGATAGCTTTAGAACTGCTTGGATTAGACTTTGACGCTGCTAACTATAAGgtaatgcgatgttcttataagatatatgtcaaatcaaaacttattgaagaatacacagcaaatgctattgtctcttttggtgacgatatag
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT1G27110.1 |
intron # | 12 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
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EST: AGATAGCTTTAGAACTGCTTGGATTAGACTTTGACGCTGCTAACTATAAG GTGATTGGAGGATCGGGTTTACAGATGGATGTTTTTAATGAAATCTGGTACEST: gi|116428724|gb|EG471316.1|EG471316
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EST: AGATAGCTTTAGAACTGCTTGGATTAGACTTTGACGCTGCTAACTATAAG -TGATTGGAGGATCGGGTTTACAGATGGATGTTTTTAATGAAATCTGGTACEST: gi|116428723|gb|EG471315.1|EG471315
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EST: AGATAGCTTTAGAACTGCTTGGATTAGACTTTGACGCTGCTAACTATAAG GTGATTGGAGGATCGGGTTTACAGATGGATGTTTTTAATGAAATCTGGTACEST: gi|116428730|gb|EG471322.1|EG471322
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EST: AGATAGCTTTAGAACTGCTTGGATTAGACTTTGACGCTGCTAACTATAAG GTGATTGGAGGATCGGGTTTACAGATGGATGTTTTTAATGAAATCTGGTACEST: gi|116428747|gb|EG471339.1|EG471339
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EST: AGATAGCTTTAGAACTGCTTGGATTAGACTTTGACGCTGCTAACTATAAG GTGATTGGAGGATCGGGTTTACAGATGGATGTTTTTAATGAAATTTGGTACEST: gi|116378182|gb|EG420774.1|EG420774
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EST: AGATAGCTTTAGAACTGCTTGGATTAGACTTTGACGCTGCTAACTATAAG GTGATTGGAGGATCGGGTTTACAGATGGATGTTTTTAATGAAATTTGGTACEST: gi|116428732|gb|EG471324.1|EG471324
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EST: AGATAGCTTTAGAACTGCTTGGATTAGACTTTGACGCTGCTAACTATAAG GTGATTGGAGGATCGGGTTTACAGATGGATGTTTTTAATGAAATCTGGTACEST: gi|116428727|gb|EG471319.1|EG471319
genomic: AGATAGCTTTAGAACTGCTTGGATTAGACTTTGACGCTGCTAACTATAAGgtaatgcgat ... gacgatatagGTGATTGGAGGATCGGGTTTACAGATGGATGTTTTTAATGAAATCTGGTAC
EST: AGATAGCTTTAGAACTGCTTGGATTAGACTTTGACGCTGCTAACTATAAG GTGATTGGAGGATCGGGTTTACAGATGGATGTTTTTAATGAAATCTGGTACEST: gi|116428721|gb|EG471313.1|EG471313
genomic: AGATAGCTTTAGAACTGCTTGGATTAGACTTTGACGCTGCTAACTATAAGgtaatgcgat ... gacgatatagGTGATTGGAGGATCGGGTTTACAGATGGATGTTTTTAATGAAATCTGGTAC
EST: AGATAGCTTTAGAACTGCTTGGATTAGACTTTGACGCTGCTAACTATAAG GTGATTGGAGGATCEST: gi|116428725|gb|EG471317.1|EG471317
genomic: AGATAGCTTTAGAACTGCTTGGATTAGACTTTGACGCTGCTAACTATAAGgtaatgcgat ... gacgatatagGTGATTGGAGGATC
EST: AGATAGCTTTAGAACTGCTTGGATTAGACTTTGACGCTGCTAACTATAAG GTGATTGGAGGATCGGGTTTACAGATGGATGTTTTTAATGAAATCTGGTAC
genomic: AGATAGCTTTAGAACTGCTTGGATTAGACTTTGACGCTGCTAACTATAAGgtaatgcgat ... gacgatatagGTGATTGGAGGATCGGGTTTACAGATGGATGTTTTTAATGAAATCTGGTAC
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| CTTGCTGAAGCTGTTTATGAATACGGGAAAGGAAACTACGAGATAGCTTTAGAACTGCTTGGATTAGACTTTGACGCTGCTAACTATAAGgtaatgcgatgttcttataagatatatgtcaaatcaaaacttattgaagaatacacagcaaatgctattgtctcttttggtgacgatatag
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