Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtgcaaccattgctaagatggtaacgtgcaacaggatactgatagttagaggagtggggactggggacatagtgaaagtgatgcttagaagctatgtatcttgttttttattatgatatcaagatatgtgttttatccattttctgtcatatgcttgtatgatgcatggaagctgatgagtgtgtcctatatgtttttagTCCCTTTTCCAAAATGATTCTCCTACAACATTACTTGCTCGTGTGATGGGCACCATTGGCTTCATAGAACAAGTTATGCTTGCACGCCACACCTACAAAT

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G451217_T01
intron # 1
splice site 3'
intron type U2


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

gtcatatgcttgtatgatgcatggaagctgatgagtgtgtcctatatgtttttagTCCCTTTTCCAAAATGATTCTCCTACAACATTACTTGCTCGTGTGATGGGCACCATTGGCTTCATAGAACAAGTTATGCTTGCACGCCACACCTACAAAT
                         agctgat  putative branch site (score: 4)
                                              tgttttt  putative PPT
                                          tatatgttttta  TA-rich tract