Sequence
atgc intronic sequence ATGC exonic sequence...catgccttgtttgtcgcttctcggctttgcgcttctgatgcactgtggcatgcaaattaagctgccttataagagccgaatgcttccctgccgtgtccagGTCCAGACAGAGGTCTCTAGCCGTGCAGCGGTGCTGTCGTTGGTGGCGGCCGGCGACTTGGAGCTGTCGAGGTAAGCAAGCTGGTGTGGCGGCGATTGGA
Basic information
atgc intronic sequence ATGC exonic sequenceIntronic sequence truncated to 55 bases.tggcatgcaaattaagctgccttataagagccgaatgcttccctgccgtgtccagGTCCAGACAGAGGTCTCTAGCCGTGCAGCGGTGCTGTCGTTGGTGGCGGCCGGCGACTTGGAGCTGTCGAGGTAAGCAAGCTGGTGTGGCGGCGATTGGA
cttccctgcc CT-rich tract
aaattaa TA-rich tract
Putative cis-regulatory sequences
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
| | ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|
catgccttgtttgtcgcttctcggctttgcgcttctgatgcactgtggcatgcaaattaagctgccttataagagccgaatgcttccctgccgtgtccagGTCCAGACAGAGGTCTCTAGCCGTGCAGCGGTGCTGTCGTTGGTGGCGGCCGGCGACTTGGAGCTGTCGAGGTAAGCAAGCTGGTGTGGCGGCGATTGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TTGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGCAA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGCAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CAAGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGCTG
catgcct
- - - -tgtttgt
- - - - - - - -gcttctc
- - - - - - - - - - - - - - - gcttctg
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - tgcactg
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ggcatgc
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -agctgcc