Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtgcttatgttgctttactgctgacataaattgctcttaggcattctatattatctaaaactggttacttttttttttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCATGCCATCACTG

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G071630_T01
intron # 6
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM2G071630_T02 (Zea mays), 3'ss of exon 5
lower sequence: LOC_Os02g38920.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 6
gtgcttatgttgctttactgctgacataaattgctcttaggcattctatattatctaaaact---ggttacttttttttttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCATGCCATCACTG
||| ||||  || | || |  || |      | || |  |    |   || ||    |   |   | | || |||| | ||| | ||||||||||||||||  || || || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||
gtgtttattctgatataat-ttggcgcctgctcctgtgcgcatgtagctactactggagttttaagctaacattttgtcttgttacagGTCATCAATGACAGATTTGGCATCGTTGAGGGTTTGATGACCACTGTCCATGCCATCACTG

upper sequence: GRMZM2G071630_T02 (Zea mays), 3'ss of exon 5
lower sequence: GLYMA04G36860.2 (Glycine max), 3'ss of exon 5
gtgcttatgttgctttactgctgacataaattgctcttaggcatt---ctatattatctaaaactggttacttttttttt---tgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCATGCCATCACTG
||  | || || ||  ||   |   | |  ||| | ||     ||   ||||  ||| ||   ||  ||  || ||   |   |  ||||||| || ||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
gt-ttcatatt-ctggacaattctaacatgttgattttgaatttttgactattatatttagtcctaattgtttcttgcctaaattttgcagGTTATTAATGACAGGTTTGGCATTGTTGAGGGTTTGATGACCACTGTTCATTCCATCACTG

upper sequence: GRMZM2G071630_T02 (Zea mays), 3'ss of exon 5
lower sequence: GLYMA18G01330.1 (Glycine max), 3'ss of exon 6
----------------------gtgcttatgttgctttactgctgacataaattgctcttaggcattctatattatctaa--aactggttacttttttttttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCATGCCATCACTG
                      ||| | || ||  |||| |||||     |  ||   |      ||  || ||   |||  || |  |||  | ||  |||  | ||||| ||||| |||   || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |
gtttattttgatttatacccttgtgat-atatttatttattgctgcttccatctgtattataaatttgcatttttcttaatgaaattattaaatcttaattttgtacagGTTATCAACGACCGATTTGGAATTGTGGAGGGTCTTATGACCACTGTTCATGCCATCACAG

upper sequence: GRMZM2G071630_T02 (Zea mays), 3'ss of exon 5
lower sequence: GLYMA11G37360.1 (Glycine max), 3'ss of exon 6
-----------gtgcttatgttgctt-tactgctgacataaattgctcttaggcattctatattatctaa--aactggttacttttttttttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCATGCCATCACTG
            |  ||||    ||| || |  ||| |||  |   | ||     ||| || || |  ||  || |  ||| | ||  ||||||  ||||| ||||| |||   || || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |
gtttattttgttttattataccccttgtagttgtgatatatttatttatttctgcttccattttttaaaatgaaattattaatcttaattttgc-acagGTTATCAACGACCGATTTGGAATTGTGGAGGGTCTTATGACCACTGTTCACGCCATCACAG

upper sequence: GRMZM2G071630_T02 (Zea mays), 3'ss of exon 5
lower sequence: GLYMA06G18120.1 (Glycine max), 3'ss of exon 6
-gtgcttatgttgctttactgctgacataaattgctcttaggcatt---ctatattatctaaaactggttacttttttttt---tgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCATGCCATCACTG
  | | |||  ||    |  |     | |  ||| | ||    |||   || |  ||| ||   ||  ||  || || | |   |  ||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
gttccatattctggacaatggaactaacacgttgattttgactatttgactgttatatgtagtcctaattgtttcttgtctaaattttgcagGTTATCAATGACAGGTTTGGCATTGTTGAGGGTTTGATGACCACTGTTCATTCCATCACTG

upper sequence: GRMZM2G071630_T02 (Zea mays), 3'ss of exon 5
lower sequence: GLYMA06G18110.5 (Glycine max), 3'ss of exon 6
----gtgcttatgttgctttactgctgacataaattgctcttaggcattctatattatc-taaaactggttacttttttttt-tgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCATGCCATCACTG
    |   ||  |  | ||  ||| | | ||  |||  | |  |   ||    |||||  ||   ||  ||  || || |   |  ||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |
gtttgcaattcagcagatt--ctgttta-atggatttttttgtgttgtttgtgattattatagtccttattgtttcttgtcaattttgcagGTTATCAATGACAGGTTTGGCATTGTTGAGGGTTTGATGACCACTGTTCATTCCATCACCG

upper sequence: GRMZM2G071630_T02 (Zea mays), 3'ss of exon 5
lower sequence: GLYMA04G36870.1 (Glycine max), 3'ss of exon 6
gtgcttatgttgcttta--ctgctgacataaattgctcttaggcattctat-attatc-taaaactggttacttttttttt-tgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCATGCCATCACTG
||    |  |  |   |  ||| | | ||  |||  | ||  |     | | | |||  ||   ||   |  || || |   |  ||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
gtttgcaattcaccggattctgttta-atggattttttttgtgttggttgtgactattatagtccttactgtttcttgtcaattttgcagGTTATCAATGACAGGTTTGGCATTGTTGAGGGTTTGATGACCACTGTTCATTCCATCACTG

upper sequence: GRMZM2G071630_T02 (Zea mays), 3'ss of exon 5
lower sequence: Vv14s0171g00440.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 5
-------gtgcttatgttgctttactgctgacataaattgctcttaggcattctatattatctaaaactg-gttactttttttt-------ttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCATGCCATCACTG
        |  ||| |||     ||   |  ||    |     | || ||||   |    | | |  ||  ||||    | ||        ||    ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||
tttatttataattaagttaaaaaacaaataccacctctgcaattgagccattgactgaattttgatcctatgttatgcctcttgaaataaatttggacagGTCATCCATGACAAATTTGGTATTGTTGAGGGTCTTATGACCACTGTCCATTCCATCACTG

upper sequence: GRMZM2G071630_T02 (Zea mays), 3'ss of exon 5
lower sequence: Vv01s0010g02460.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 6
---------gtgcttatgttgctttactgctgacataaattgct-cttaggcattctatattatctaaaactggttacttttttttttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCATGCCATCACTG
          | |  ||  |  |||  | || |  |  |||||  |||     || |  |||  || | | |   ||  |    ||||    ||||| || |||||||  || || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||
gttgcttcgatacccattgtattttgat-ctaagttttattgcaacttgtttgttgttcattgccttagattttctatgtgaaatttta---cagGTTATTAATGACAGATTTGGCATTGTTGAGGGTCTTATGACCACTGTTCACGCCATCACTG

upper sequence: GRMZM2G071630_T02 (Zea mays), 3'ss of exon 5
lower sequence: EFJ30760 (Selaginella moellendorffii), 3'ss of exon 6
gtgcttatgttgctttactgctgacataaattgctcttaggcattctatattatctaaaactggttacttttttt--tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCATGCCATCACTG
             | |  |||   | |  ||||   ||   | |   |  || || |    | | |  || |  |  | | || ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||  |  | ||||
------------gtgtgttgcgagcttccattgtcttt--ccgtcaaagtttctcgactgttcgatgtttctgataatcttctccagGTCATCCATGACAAGTTCGGCATCGTGGAGGGCCTCATGACCACTGTGCACTCACTAACTG

upper sequence: GRMZM2G071630_T02 (Zea mays), 3'ss of exon 5
lower sequence: EFJ22884 (Selaginella moellendorffii), 3'ss of exon 6
gtgcttatgttgctttactgctgacataaattgctcttaggcattctatattatctaaaactggttacttttttt--tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCATGCCATCACTG
             | |  |||   | |  ||||   ||   | |   |  || || |    | | |  || |  |  | | || ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||  |  | ||||
------------gtgtgttgcgagcttccattgtcttt--ccgtcacagtttctcgactgttcgatgtttctgataatcttctccagGTCATCCATGACAAGTTCGGCATCGTGGAGGGCCTCATGACCACTGTGCACTCGCTAACTG

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|67012665|gb|CO441414.1|CO441414
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67025954|gb|CO454703.1|CO454703
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|47962058|gb|CN844767.1|CN844767
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGANGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|211222379|gb|FL093092.1|FL093092
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67024899|gb|CO453648.1|CO453648
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67041497|gb|CO467752.1|CO467752
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|31348943|gb|CD433300.1|CD433300
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67015845|gb|CO444594.1|CO444594
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|56461956|gb|CK986254.1|CK986254
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|14204222|gb|BG837899.1|BG837899
EST:     TGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCYTTS-TCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCC-TTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67014546|gb|CO443295.1|CO443295
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67025410|gb|CO454159.1|CO454159
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|211234760|gb|FL093185.1|FL093185
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGTCTTGCTCCTCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|44681823|gb|CK786871.1|CK786871
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67010781|gb|CO439530.1|CO439530
EST:     TTGTCTCTTATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67022938|gb|CO451687.1|CO451687
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67032636|gb|CO461385.1|CO461385
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|211375209|gb|FL093290.1|FL093290
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGTCTTGCTCCTCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67021229|gb|CO449978.1|CO449978
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|32867595|gb|CF007277.1|CF007277
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGTCTTGCTCCTCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|32864955|gb|CF004637.1|CF004637
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGTCTTGCTCCTCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67011586|gb|CO440335.1|CO440335
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67020629|gb|CO449378.1|CO449378
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|7238106|gb|AW573328.1|AW573328
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGTCTTGCTCCTCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67021402|gb|CO450151.1|CO450151
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|116816648|gb|EC859413.1|EC859413
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67010334|gb|CO439083.1|CO439083
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|33093108|gb|CF053102.1|CF053102
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGTCTTGCTCCTCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACCAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCA
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGA-CAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCA
EST: gi|149004350|gb|EE039048.2|EE039048
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67015261|gb|CO444010.1|CO444010
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|213178203|gb|FM190558.1|FM190558
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGTCTTGCTCCTCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|62550425|gb|DN830845.1|DN830845
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|5325097|gb|AI783288.1|AI783288
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67022863|gb|CO451612.1|CO451612
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67018785|gb|CO447534.1|CO447534
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|31349612|gb|CD433969.1|CD433969
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67010886|gb|CO439635.1|CO439635
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67013622|gb|CO442371.1|CO442371
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|211224444|gb|FL093112.1|FL093112
EST:     TGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGGCTTGCTCCGCTTGGCTA-G                         G-CATCAGTGACAAGTTCGGNATTTGTTGAGGGTCTGATGACCACTG
genomic: TGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTG-CTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATT-GTTGAGGGTCTGATGACCACTG
EST: gi|67015860|gb|CO444609.1|CO444609
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|31363575|gb|CD447932.1|CD447932
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|31352642|gb|CD436999.1|CD436999
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67019795|gb|CO448544.1|CO448544
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67011005|gb|CO439754.1|CO439754
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|211367234|gb|FL093250.1|FL093250
EST:     TGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTAT
genomic: TGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCC-TTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTAT
EST: gi|211220316|gb|FL093085.1|FL093085
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTG
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTG
EST: gi|211372544|gb|FL093277.1|FL093277
EST:     TGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCT
genomic: TGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTT-GCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCT
EST: gi|211234752|gb|FL093177.1|FL093177
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|33103670|gb|CF063630.1|CF063630
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGTCTTGCTCCTCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACCAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCA
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGA-CAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCA
EST: gi|67016602|gb|CO445351.1|CO445351
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|61236817|gb|DN586542.1|DN586542
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGA
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGA
EST: gi|67031748|gb|CO460497.1|CO460497
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|211232701|gb|FL093174.1|FL093174
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         G-CATCAATGA
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGA
EST: gi|31250232|gb|CD219256.1|CD219256
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67016980|gb|CO445729.1|CO445729
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67024469|gb|CO453218.1|CO453218
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|14202290|gb|BG835967.1|BG835967
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|84977581|gb|DW476003.1|DW476003
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67024565|gb|CO453314.1|CO453314
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67015763|gb|CO444512.1|CO444512
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67011894|gb|CO440643.1|CO440643
EST:     CTCTAATGCTTGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: CTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|211224433|gb|FL093101.1|FL093101
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67018855|gb|CO447604.1|CO447604
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67016674|gb|CO445423.1|CO445423
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|31348958|gb|CD433315.1|CD433315
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67021139|gb|CO449888.1|CO449888
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAAGT-CGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCA
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAA-GTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCA
EST: gi|67041827|gb|CO468082.1|CO468082
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGTCTTGCTCCTCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|31351468|gb|CD435825.1|CD435825
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67022453|gb|CO451202.1|CO451202
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|211234759|gb|FL093184.1|FL093184
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|31359097|gb|CD443454.1|CD443454
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67013807|gb|CO442556.1|CO442556
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|31354903|gb|CD439260.1|CD439260
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67019757|gb|CO448506.1|CO448506
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|211369886|gb|FL093259.1|FL093259
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAAC-AACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACC
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACC
EST: gi|67022132|gb|CO450881.1|CO450881
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67011387|gb|CO440136.1|CO440136
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67023909|gb|CO452658.1|CO452658
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67022702|gb|CO451451.1|CO451451
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67011271|gb|CO440020.1|CO440020
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67031809|gb|CO460558.1|CO460558
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67018865|gb|CO447614.1|CO447614
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|32932875|gb|CF037687.1|CF037687
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGTCTTGCTCCTCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACCAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCA
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGA-CAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCA
EST: gi|14204211|gb|BG837888.1|BG837888
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTTCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67037411|gb|CO464235.1|CO464235
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67010329|gb|CO439078.1|CO439078
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67015129|gb|CO443878.1|CO443878
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|440734|gb|T14755.1|T14755
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGNTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|44901025|gb|CK827570.1|CK827570
EST:     TCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67013846|gb|CO442595.1|CO442595
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67017532|gb|CO446281.1|CO446281
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|149110365|gb|EE190377.2|EE190377
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|33093662|gb|CF053656.1|CF053656
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGTCTTGCTCCTCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACCAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCA
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGA-CAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCA
EST: gi|108953409|gb|EC364728.1|EC364728
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67019697|gb|CO448446.1|CO448446
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67015591|gb|CO444340.1|CO444340
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|211228568|gb|FL093139.1|FL093139
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGTCTTGCTCCTCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67013925|gb|CO442674.1|CO442674
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|58029889|gb|CX725316.1|CX725316
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|31360311|gb|CD444668.1|CD444668
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67016275|gb|CO445024.1|CO445024
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|37400978|gb|CF637850.1|CF637850
EST:     TAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|78083107|gb|DV511500.1|DV511500
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
EST: gi|67025014|gb|CO453763.1|CO453763
EST:     TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAG                         GTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT
genomic: TTGTCTCTAATGCTAGCTGCACAACCAACTGCCTTGCTCCGCTTGCTAAGgtgcttatgt ... tttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCAT


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

ttgctcttaggcattctatattatctaaaactggttacttttttttttgctgcagGTCATCAATGACAAGTTCGGTATTGTTGAGGGTCTGATGACCACTGTTCATGCCATCACTG
                      atctaaa  putative branch site (score: 3)
                                  ttacttttttttttgc  putative PPT
            attctatattatctaa  TA-rich tract