Sequence
atgc intronic sequence ATGC exonic sequence...aagcaagccaacttgatatattatcttatattcttatttatgtttaccctgtacgaattttcttaacaaattggcataccttcacgtatcgttgatccagTATGTGTACTGCGACTCAGAGGTGATGCACATGCTGGCGCAGATCCTGCTGCCCGGCCTCGCTGTCATCTGTGTTGACGGTAGCATGGAGGACCTGTTCG
Basic information
atgc intronic sequence ATGC exonic sequenceIntronic sequence truncated to 55 bases.accctgtacgaattttcttaacaaattggcataccttcacgtatcgttgatccagTATGTGTACTGCGACTCAGAGGTGATGCACATGCTGGCGCAGATCCTGCTGCCCGGCCTCGCTGTCATCTGTGTTGACGGTAGCATGGAGGACCTGTTCG
aattttcttaacaaat TA-rich tract
Putative cis-regulatory sequences
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
| | ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|
aagcaagccaacttgatatattatcttatattcttatttatgtttaccctgtacgaattttcttaacaaattggcataccttcacgtatcgttgatccagTATGTGTACTGCGACTCAGAGGTGATGCACATGCTGGCGCAGATCCTGCTGCCCGGCCTCGCTGTCATCTGTGTTGACGGTAGCATGGAGGACCTGTTCG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CATGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGAGG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGGA
- gcaagcc
- - - - - - - - - - - - - - - - - - -ttatgtt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ccctgta
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - aacaaat
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -gcatacc