1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
...attgtttgcatcataacaatgtcatcatcatgtaaattaaagatgcaaacaaacattaaacaatcacagtgactttgtgtgtactgtttgaacattatagTGTTTCAAGATTCCGCGGACTCAGGATTGTGTCATCATATATGGGAGTTGGAGGAC
species | Zea mays |
transcript | AC193440.3_FGT009 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
caaacaaacattaaacaatcacagtgactttgtgtgtactgtttgaacattatagTGTTTCAAGATTCCGCGGACTCAGGATTGTGTCATCATATATGGGAGTTGGAGGAC
aaacattaaacaat TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| attgtttgcatcataacaatgtcatcatcatgtaaattaaagatgcaaacaaacattaaacaatcacagtgactttgtgtgtactgtttgaacattatagTGTTTCAAGATTCCGCGGACTCAGGATTGTGTCATCATATATGGGAGTTGGAGGAC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TTGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGAGG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGGA
- tgtttgc
- - - - - -cataacaa
- - - - - - - - - - - - - - catgtaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - aaacaaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -aaacaat
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -tgtactg