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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GGAACATCTCGCCCAGCACATTATCATGTCTTGCTTGATGAGATTAGCTTCTCTCCTGATGACTTGCAACATCTTATCCACTCCCTATCATATGTgtaagccttctctccaaattatttctcttctggggttgcacttgaatgttccaagtggaattattaatttctcttttgcttaactcag

Basic information

species Vitis vinifera
transcript Vv12s0059g01430.t01
intron # 21
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: Vv12s0059g01430.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 21
lower sequence: AT2G32940.1 (Arabidopsis thaliana), 5'ss of exon 21
GGAACATCTCGCCCAGCACATTATCATGTCTTGCTTGATGAGATTAGCTTCTCTCCTGATGACTTGCAACATCTTATCCACTCCCTATCATATGTgtaagccttctctccaa-attatttctcttctggggttgcacttgaatgttccaagtggaattattaatttctcttttgcttaactcag
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GGAACTTCAAGACCGGCTCATTACCATGTATTACTTGATGAGATTGGTTTCTCCCCCGATGACTTGCAGAATCTCATCCATTCTCTCTCCTATGTgtaagttcactccttaacgtcaattacaaaaaccaacttagctttaccatcactaa-gatctaattgtctcgaatcatcatcattccag