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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtacgtcgtttttgctcgtgccaaaagctaatactttctccagGTTGGGACAATGTCTTTCTGTTTTCTTTCACAACTACGCGTCGGCTACACCAGAACATAAG

Basic information

species Selaginella moellendorffii
transcript EFJ37807
intron # 8
splice site 3'
intron type U2


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

gtacgtcgtttttgctcgtgccaaaagctaatactttctccagGTTGGGACAATGTCTTTCTGTTTTCTTTCACAACTACGCGTCGGCTACACCAGAACATAAG
                                     agctaat  putative branch site (score: 3)
                                           tactttctcc  CT-rich tract
                                        taatacttt  TA-rich tract