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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtagagtaatcgcttttatggattgtcttcgtcctaactggagtatcttttgctttctcgtcttccagGTTCTCCGCTATGTCGCTTGTATCTTCCTTGGTGAGAATCGCAAATGCCGAAACACCATTCGACAGATACTCTGGAACGGCACCTCCGTCAACTGAATCG

Basic information

species Selaginella moellendorffii
transcript EFJ22275
intron # 4
splice site 3'
intron type U2


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

ttttatggattgtcttcgtcctaactggagtatcttttgctttctcgtcttccagGTTCTCCGCTATGTCGCTTGTATCTTCCTTGGTGAGAATCGCAAATGCCGAAACACCATTCGACAGATACTCTGGAACGGCACCTCCGTCAACTGAATCG
                  tcctaac  putative branch site (score: 1)
                              tatcttttgctttctc  putative PPT
                              tatctttt  TA-rich tract