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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

ATAGAAAAGCAAGAATTTGGTCTGAAGCCCATGAATTGTCCCGGCCATTGTTTACTTTTCCAACACAGGGTCCGTTCATATCGAGgtagggagtctgcaacatgactgtgtttgtctaacgagattatatatatttacgtag

Basic information

species Selaginella moellendorffii
transcript EFJ09242
intron # 12
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: EFJ09242 (Selaginella moellendorffii), 5'ss of exon 12
lower sequence: LOC_Os08g19850.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 11
ATAGAAAAGCAAGAATTTGGTCTGAAGCCCATGAATTGTCCCGGCCATTGTTTACTTTTCCAACACAGGGTCCGTTCATATCGAGgtagggagtctgcaacatgactgtgtttgtctaacgagat-tatatatatttacgtag--------------------------------------------
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ATTGAGAAACAGGAATTTGGTCTCAAGCCAATGAATTGTCCTGGCCATTGCCTAATGTTTGAGCACAGGGTTCGTTCATACAGAGgtaaatctccttcataatggc-atagttgtatcacaaaatgtatctct-tttatcaagtgaaaattcctgctgtcaaagtaatcgcttcaaccttctgcctg