1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
...agccccccgagtttccggtagatgcaagagctcctgagcgatggcggacgcggcagtgctcgcaagcagcgtcatcacaagcttcattcaaggtgtgaagGCTCTCAAGGACGCGTCTGTGAATCTAGATGAGGCGCCATCGAACTTTCAGAACTTGAAGAGGTTAGTGACCCAGCTAGAGAGCTCCGTGACCAAGACAG
species | Selaginella moellendorffii |
transcript | EFJ07549 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| agccccccgagtttccggtagatgcaagagctcctgagcgatggcggacgcggcagtgctcgcaagcagcgtcatcacaagcttcattcaaggtgtgaagGCTCTCAAGGACGCGTCTGTGAATCTAGATGAGGCGCCATCGAACTTTCAGAACTTGAAGAGGTTAGTGACCCAGCTAGAGAGCTCCGTGACCAAGACAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TTGAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGAAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGAGG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGAGCT
- - - - - gtttccg
- - - - - - - - - -agatgca
- - - - - - - - - - - - - agagctc
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -gtgctcg
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - agcagcg