1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
TTCAAGAAGTCCACCCCATAGATCCTGACTTCTGTATCCGGTATAGCAGGAACCAGATCATACAGAGTGACGCAGGGGTGTTTATAAACTCTTTCCACGAgtaagttttggtcaagcccaaaactttgatatctttcttgtcatggaaatcgatccaaaagtccaattctttttagttttttggagaaatagaggaatgc...
species | Selaginella moellendorffii |
transcript | EFJ07493 |
intron # | 1 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TTCAAGAAGTCCACCCCATAGATCCTGACTTCTGTATCCGGTATAGCAGGAACCAGATCATACAGAGTGACGCAGGGGTGTTTATAAACTCTTTCCACGAgtaagttttggtcaagcccaaaactttgatatctttcttgtcatggaaatcgatccaaaagtccaattctttttagttttttggagaaatagaggaatgc
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGATCA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -tctttct
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - atggaaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -tcttttt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ttttttg
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - agaaata
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -gaggaatg