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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtaggcttacattctccgatgtaatcgcccctttcaatggatgacaatctctacaattttgtggcagaatgtgagacaaggtgggcagattggtgtttgtggactaattcattgtgatcgcatcctatacagcctgcaaattaacagTCAATACAGTGTGGCGAGCGTGGTGGAGTCCATGCTGCCCGTTTATCGATATCTTCTCACGAAGGGCCTAAAAATTTGGATTTACAG

Basic information

species Physcomitrella patens
transcript PP1S98_110V6.1
intron # 8
splice site 3'
intron type U2


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

gtgtttgtggactaattcattgtgatcgcatcctatacagcctgcaaattaacagTCAATACAGTGTGGCGAGCGTGGTGGAGTCCATGCTGCCCGTTTATCGATATCTTCTCACGAAGGGCCTAAAAATTTGGATTTACAG
         gactaat  putative branch site (score: 2)
            taattcatt  TA-rich tract