1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
...tgtcttttgcagcagtcgccttgttttcaattgttcacttgaggaaaattgagagttgttttctttgacgattgaccgattcggtgtgttgaaattgcagATGAAAAGAGATGCTATAGCAAACACGGTTTATGAAGCTATGCCAAATCCATCCGAGCATAAGTACACTAAGCTTTTTACTTGTTTAATTTAAATTTATC
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S92_44V6.3 |
intron # | 6 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CCGATGCGACGCATGTGCATTATATTGGATTACGTGGAGAAGCTACACAA ATGAAAAGAGATGCTATAGCAAACACGGTTTATGAAGCTATGCCAAATCCAEST: gi|67578191|gb|BJ950358.1|BJ950358
genomic: CCGATGCGACGCATGTGCATTATATTGGATTACGTGGAGAAGCTACACAAgtgagcagtt ... gaaattgcagATGAAAAGAGATGCTATAGCAAACACGGTTTATGAAGCTATGCCAAATCCA
EST: CCGATGCGACGCATGTGCATTATATTGGATTACGTGGAGAAGCTACACAA ATGAAAAGAGATGCTATAGCAAACACGGTTTATGAAGCTATGCCAEST: gi|162201174|gb|FC377681.1|FC377681
genomic: CCGATGCGACGCATGTGCATTATATTGGATTACGTGGAGAAGCTACACAAgtgagcagtt ... gaaattgcagATGAAAAGAGATGCTATAGCAAACACGGTTTATGAAGCTATGCCA
EST: CCGATGCGACGCATGTGCATTATATTGGATTACGTGGAGAAGCTACACAA ATGAAAAGAGATGCTATAGCAAACACGGTTTATGAAGCTATGCCAAATCCA
genomic: CCGATGCGACGCATGTGCATTATATTGGATTACGTGGAGAAGCTACACAAgtgagcagtt ... gaaattgcagATGAAAAGAGATGCTATAGCAAACACGGTTTATGAAGCTATGCCAAATCCA
aaattgagagttgttttctttgacgattgaccgattcggtgtgttgaaattgcagATGAAAAGAGATGCTATAGCAAACACGGTTTATGAAGCTATGCCAAATCCATCCGAGCATAAGTACACTAAGCTTTTTACTTGTTTAATTTAAATTTATC
gattgac putative branch site (score: 3)
ttttcttt TA-rich tract