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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TTCAACTACTGGCGACTGTGTTCATGTCGATTTCAGTTGCCTTTTCGACAAAGGGCTCTCACTAGAAAAACCTGAGGTGGTGCCATTTCGTCTCACCCAGgtaagttcgtgccaacgtttgatagtcattagtgtggttgaaccgagttgagacgtcgattcattattttttatccaatgatcctacattcaattcgtac...

Basic information

species Physcomitrella patens
transcript PP1S77_262V6.1
intron # 24
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: PP1S77_262V6.1 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 24
lower sequence: Vv03s0038g02970.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 13
TTCAACTACTGGCGACTGTGTTCATGTCGATTTCAGTTGCCTTTTCGACAAAGGGCTCTCACTAGAAAAACCTGAGGTGGTGCCATTTCGTCTCACCCAGgtaagttcgtgccaacgtttgatagtcattagtgtggt-tgaaccgagttgagacgtcgattcattattttt--tatccaatgatcctacattcaattcgtac
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TTCTACCACAGGAGACTGTGTTCATGTTGATTTCAGTTGCTTATTTGACAAAGGCTTGCAGCTGGAGAAGCCAGAGCTGGTGCCTTTTAGGCTAACCCAGgtaagga-atgcacatggatgctcatgttccatgcaatgtgaaaattttccccataacaagtc-ttattcctgacatttatttagcaaatgccagatttggt-