1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
...cagcgatgaaattcaactcatgaagcaatctgccttaaatgtttaatagtcaaatgtagtagggttggggccttcaacgattcctcgtgtttgcctacagGTGAAAACGCTCGTTGTCGGGCAGTTACTTTATACCTTAGCATGCTATGTTATTCGTAACTGATTCGGCATGGTTGCTGTATGCTCCACAAATTCATTAC
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S6_204V6.1 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GAATACATATGATCGTCGTGGCCAAGGTGGTTACTCTACTACATATGCAG GTGAAAACGCTCGTTGTCGGGCAGTTACTTTATACCTTAGCATGCTATGTT
genomic: GAATACATATGATCGTCGTGGCCAAGGTGGTTACTCTACTACATATGCAGgtgggaatcg ... ttgcctacagGTGAAAACGCTCGTTGTCGGGCAGTTACTTTATACCTTAGCATGCTATGTT
atagtcaaatgtagtagggttggggccttcaacgattcctcgtgtttgcctacagGTGAAAACGCTCGTTGTCGGGCAGTTACTTTATACCTTAGCATGCTATGTTATTCGTAACTGATTCGGCATGGTTGCTGTATGCTCCACAAATTCATTAC
gtttaat putative branch site (score: 2)
tttgcct putative PPT
aaatgta TA-rich tract