1 5' 3' | 2 5' 3' |
...cttttccaatcagaaaggagtcgtgcaagtggcgcgaacacaggttttgggcttctgaaggagtatcttgcttatcttgtcaacatccttgattgtgcagTGGAATCTACAGCATGCCAGAGAGGGATGGCTTAAAATATCATGATGCGGTGAATGAGATTTCGGATAAGTTCTTTAGCTCGTACAGACGATAACTCGAA
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S6_134V6.2 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: AGCGTGCCGTGAAGTAGCTGCGTGGATTCGATGTCTCCCCCGGTTTGAAG TGGAATCTACAGCATGCCAGAGAGGGATGGCTTAAAATATCATGATGCGGTEST: gi|100451442|gb|CJ974768.1|CJ974768
genomic: AGCGTGCCGTGAAGTAGCTGCGTGGATTCGATGTCTCCCCCGGTTTGAAGgtgagaattc ... gattgtgcagTGGAATCTACAGCATGCCAGAGAGGGATGGCTTAAAATATCATGATGCGGT
EST: AGCGTGCCGTGAAGTAGCTGCGTGGATTCGATGTCTCCCCCGGTTTGAAG TGGAATCTACAGCATGCCAGAGAGGGATGGCTTAAAATATCATGATGCGGT
genomic: AGCGTGCCGTGAAGTAGCTGCGTGGATTCGATGTCTCCCCCGGTTTGAAGgtgagaattc ... gattgtgcagTGGAATCTACAGCATGCCAGAGAGGGATGGCTTAAAATATCATGATGCGGT
tttgggcttctgaaggagtatcttgcttatcttgtcaacatccttgattgtgcagTGGAATCTACAGCATGCCAGAGAGGGATGGCTTAAAATATCATGATGCGGTGAATGAGATTTCGGATAAGTTCTTTAGCTCGTACAGACGATAACTCGAA
ccttgat putative branch site (score: 2)
ttatctt TA-rich tract