Mapped EST sequences
Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments
ATGC EST sequence
ATGC genomic sequence (exon)
ATGC genomic sequence (truncated intron)
EST:
gi|208391565|gb|DC933814.1|DC933814EST: GACGGTCCGGAGCTCGGGTGGACCACCTTCGCGTATACTTCAACAAACAG GTCATACGCGTGTGCGCCCAAGAGCCCGTTGGCCTTTAACCTAGCCCTTGA
genomic: GACGGTCCGGAGCTCGGGTGGACCACCTTCGCGTATACTTCAACAAACAGgtttgcgttg ... gggtgctcagGTCATACGCGTGTGCGCCCAAGAGCCCGTTGGCCTTTAACCTAGCCCTTGA
EST:
gi|100448726|gb|CJ973025.1|CJ973025EST: GACGGTCCGGAGCTCGGGTGGACCACCTTCGCGTATACTTCAACAAACAG GTCATACGCGTGTGCGCCCAAGAGCCCGTTGGCCTTTAACCTAGCCCTTGA
genomic: GACGGTCCGGAGCTCGGGTGGACCACCTTCGCGTATACTTCAACAAACAGgtttgcgttg ... gggtgctcagGTCATACGCGTGTGCGCCCAAGAGCCCGTTGGCCTTTAACCTAGCCCTTGA
EST:
gi|100412645|gb|BY974837.1|BY974837EST: GACGGTCCGGAGCTCGGGTGGACCACCTTCGCGTATACTTCAACAAACAG GTCATACGCGTGTGCGCCCAAGAGCCCGTTGGCCTTTAACCTAGCCCTTGA
genomic: GACGGTCCGGAGCTCGGGTGGACCACCTTCGCGTATACTTCAACAAACAGgtttgcgttg ... gggtgctcagGTCATACGCGTGTGCGCCCAAGAGCCCGTTGGCCTTTAACCTAGCCCTTGA
EST:
gi|67718167|gb|BJ968426.1|BJ968426EST: GACGGTCCGGAGCTCGGGTGGACCACCTTCGCGTATACTTCAACAAACAG GTCATACGCGTGTGCGCCCAAGAGCCCGTTGGCCTTTAACCTAGCCCTTGA
genomic: GACGGTCCGGAGCTCGGGTGGACCACCTTCGCGTATACTTCAACAAACAGgtttgcgttg ... gggtgctcagGTCATACGCGTGTGCGCCCAAGAGCCCGTTGGCCTTTAACCTAGCCCTTGA
EST:
gi|18343111|gb|BJ175149.1|BJ175149EST: GACGGTCCGGAGCTCGGGTGGACCACCTTCGCGTATACTTCAACAAACAG GTCATACGCGTGTGCGCCCAAGAGCCCGTTGGCCTTTAACCTAGCCCTTGA
genomic: GACGGTCCGGAGCTCGGGTGGACCACCTTCGCGTATACTTCAACAAACAGgtttgcgttg ... gggtgctcagGTCATACGCGTGTGCGCCCAAGAGCCCGTTGGCCTTTAACCTAGCCCTTGA
EST:
gi|208355506|gb|DC942626.1|DC942626EST: GACGGTCCGGAGCTCGGGTGGACCACCTTCGCGTATACTTCAACAAACAG GTCATACGCGTGTGCGCCCAAGAGCCCGTTGGCCTTTAACCTAGCCCTTGA
genomic: GACGGTCCGGAGCTCGGGTGGACCACCTTCGCGTATACTTCAACAAACAGgtttgcgttg ... gggtgctcagGTCATACGCGTGTGCGCCCAAGAGCCCGTTGGCCTTTAACCTAGCCCTTGA
EST:
gi|208388011|gb|DC941678.1|DC941678EST: GACGGTCCGGAGCTCGGGTGGACCACCTTCGCGTATACTTCAACAAACAG GTCATACGCGTGTGCGCCCAAGAGCCCGTTGGCCTTTAACCTAGCCCTTGA
genomic: GACGGTCCGGAGCTCGGGTGGACCACCTTCGCGTATACTTCAACAAACAGgtttgcgttg ... gggtgctcagGTCATACGCGTGTGCGCCCAAGAGCCCGTTGGCCTTTAACCTAGCCCTTGA
EST:
gi|100399009|gb|BY990627.1|BY990627EST: GACGGTCCGGAGCTCGGGTGGACCACCTTCGCGTATACTTCAACAAACAG GTCATACGCGTGTGCGCCCAAGAGCCCGTTGGCCTTTAACCTAGCCCTTGA
genomic: GACGGTCCGGAGCTCGGGTGGACCACCTTCGCGTATACTTCAACAAACAGgtttgcgttg ... gggtgctcagGTCATACGCGTGTGCGCCCAAGAGCCCGTTGGCCTTTAACCTAGCCCTTGA
Putative cis-regulatory sequences
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
| | ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|
AAGGTCGGGGGCCGTACACAGGTGTTTCCGATGGCCGCATTCTACGATATGACGGTCCGGAGCTCGGGTGGACCACCTTCGCGTATACTTCAACAAACAGgtttgcgttggtttgcccagattttttttcctccatgtctagctcttttccttcgaacggtgcagaaaaaccaagggcattactggattaaaatagtgatgtcaaggattctggggtgctcag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGTGGA