1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
gtagttctctgcattctgattttctcgcgctaagttcgttaatatgttcagcaatgaatgcacttgtgaagttctatctttcctgtttcttccttgtgaatatgacgttttgtgtacttgttttccttgttataattgttggactaattcattggagtgtatgcagAATGGACTCCATGGAACAAGGATGGCGTCATAGCCTTGTTTGATGTTCAAACGCCAACGCCACTGCAATTCTGGACAGTGCGTGATGCGTTCAATGGTGT
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S207_6V6.1 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GAATTTTGCTGTGTTGATTGGTCCCTCGCGTGCTGATCCTGGGGATCGAG AATGGACTCCATGGAACAAGGATGGCGTCATAGCCTTGTTTGATGTTCAAAEST: gi|162193208|gb|FC371515.1|FC371515
genomic: GAATTTTGCTGTGTTGATTGGTCCCTCGCGTGCTGATCCTGGGGATCGAGgtagttctct ... gtgtatgcagAATGGACTCCATGGAACAAGGATGGCGTCATAGCCTTGTTTGATGTTCAAA
EST: GAATTTTGCTGTGTTGATTGGTCCCTCGCGTGCTGATCCTGGGGATCGAG AATGGACTCCATGGAACAAGGATGGCGTCATAGCCTTGTTTGATGTTCAAA
genomic: GAATTTTGCTGTGTTGATTGGTCCCTCGCGTGCTGATCCTGGGGATCGAGgtagttctct ... gtgtatgcagAATGGACTCCATGGAACAAGGATGGCGTCATAGCCTTGTTTGATGTTCAAA
gtgtacttgttttccttgttataattgttggactaattcattggagtgtatgcagAATGGACTCCATGGAACAAGGATGGCGTCATAGCCTTGTTTGATGTTCAAACGCCAACGCCACTGCAATTCTGGACAGTGCGTGATGCGTTCAATGGTGT
gactaat putative branch site (score: 1)
ttgttataattgtt TA-rich tract