1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
gtatgtatatataattaaacaaattgaactcatatctataaataatgcatatatgtatatttgaatatttgatggacaaattatatgaatggaccatatatatgacatatttagGTTTGGAGGCAACGAAGGAGATGACGCTGGTAGAGAAGGTGAAGCATGGAGAGTACTACATCGAAGCGGCGTGGCCATTGGGCACCGCCATTGAGGCTGT
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os11g03290.1 |
intron # | 7 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TCTATGCATGGACCTCGTTTACCAATACACCTTGCTTGTCGATGGCTTTG GTTTGGAGGCAACGAAGGAGATGACGCTGGTAGAGAAGGTGAAGCATGGAGEST: gi|87012972|gb|CI297199.1|CI297199
genomic: TCTATGCATGGACCTCGTTTACCAATACACCTTGCTTGTCGATGGCTTTGgtatgtatat ... acatatttagGTTTGGAGGCAACGAAGGAGATGACGCTGGTAGAGAAGGTGAAGCATGGAG
EST: TCTATGCATGGACCTCGTTTACCAATACACCTTGCTTGTCGATGGCTTTG GTTTGGAGGCAACGAAGGAGATGACGCTGGTAGAGAAGGTGAAGCATGGAG
genomic: TCTATGCATGGACCTCGTTTACCAATACACCTTGCTTGTCGATGGCTTTGgtatgtatat ... acatatttagGTTTGGAGGCAACGAAGGAGATGACGCTGGTAGAGAAGGTGAAGCATGGAG
tttgaatatttgatggacaaattatatgaatggaccatatatatgacatatttagGTTTGGAGGCAACGAAGGAGATGACGCTGGTAGAGAAGGTGAAGCATGGAGAGTACTACATCGAAGCGGCGTGGCCATTGGGCACCGCCATTGAGGCTGT
atttgat putative branch site (score: 5)
atatatatgacatatt TA-rich tract