1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
...aaagattatgccttccttaattatatgccttgcaagtagggtgttaggcttgtcttggtgcttgctgactcttgctgttgaattaaccttttgcttgcagGTTTTAGATTTAGTCTTTGAGTGATGCGGGTAATCGACTGCTTCTTCTAGGACTTGGAACTTAATGGGGGTAAACCCCTAGTCGGTGTGCTTGTGGTTTG
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os08g12449.3 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GCTTAAACGGTAAAGAAGTGATTTAGATGCTGACATTTTCCTGATTCAAG GTTTTAGATTTAGTCTTTGAGTGATGCGGGTAATCGACTGCTTCTT
genomic: GCTTAAACGGTAAAGAAGTGATTTAGATGCTGACATTTTCCTGATTCAAGgcaagtccca ... ttgcttgcagGTTTTAGATTTAGTCTTTGAGTGATGCGGGTAATCGACTGCTTCTT
aggcttgtcttggtgcttgctgactcttgctgttgaattaaccttttgcttgcagGTTTTAGATTTAGTCTTTGAGTGATGCGGGTAATCGACTGCTTCTTCTAGGACTTGGAACTTAATGGGGGTAAACCCCTAGTCGGTGTGCTTGTGGTTTG
aattaac putative branch site (score: 10)
ccttttgctt CT-rich tract
ttgaattaa TA-rich tract