1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
...aaagattatgccttccttaattatatgccttgcaagtagggtgttaggcttgtcttggtgcttgctgactcttgctgttgaattaaccttttgcttgcagGTTTTAGATTTAGTCTTTGAGTGATGCGGGTAATCGACTGCTTCTTCTAGGACTTGGAACTTAATGGGGGTAAACCCCTAGTCGGTGTGCTTGTGGTTTG
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os08g12449.2 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GCTTAAACGGTGAAGAAGTGATTTAGATGCTGACATTTTCCTGATTCAAG GTTTTAGATTTAGTCTTTGAGTGATGCGGGTAATCGACTGCTTCTTCTAGGEST: gi|117232269|gb|CT860026.1|CT860026
genomic: GCTTAAACGGTAAAGAAGTGATTTAGATGCTGACATTTTCCTGATTCAAGgcaagtccca ... ttgcttgcagGTTTTAGATTTAGTCTTTGAGTGATGCGGGTAATCGACTGCTTCTTCTAGG
EST: GCTTAAACGGTGAAGAAGTGATTTAGATGCTGACATTTTCCTGATTCAAG GTTTTAGATTTAGTCTTTGAGTGATGCGGGTAATCGACTGCTTCTTCTAGGEST: gi|5816513|gb|AU078110.1|AU078110
genomic: GCTTAAACGGTAAAGAAGTGATTTAGATGCTGACATTTTCCTGATTCAAGgcaagtccca ... ttgcttgcagGTTTTAGATTTAGTCTTTGAGTGATGCGGGTAATCGACTGCTTCTTCTAGG
EST: GCTTAAACGGTAAAGAAGTGATTTAGATGCTGACATTTTCCTGATTCAAG GTTTTAGATTTAGTCTTTGAGTGATGCGGGTAATCGACTGCTTCTTCTAGGEST: gi|5816512|gb|AU078109.1|AU078109
genomic: GCTTAAACGGTAAAGAAGTGATTTAGATGCTGACATTTTCCTGATTCAAGgcaagtccca ... ttgcttgcagGTTTTAGATTTAGTCTTTGAGTGATGCGGGTAATCGACTGCTTCTTCTAGG
EST: GCTTAAACGGTAAAGAAGTGATTTAGATGCTGACATTTTCCTGATTCAAG GTTTTAGATTTAGTCTTTGAGTGATGCGGGTAATCGACTGCTTCTTCTAGGEST: gi|218496359|gb|FG958513.1|FG958513
genomic: GCTTAAACGGTAAAGAAGTGATTTAGATGCTGACATTTTCCTGATTCAAGgcaagtccca ... ttgcttgcagGTTTTAGATTTAGTCTTTGAGTGATGCGGGTAATCGACTGCTTCTTCTAGG
EST: GCTTAAACGGTGAAGAAGTGATTTAGATGCTGACATTTTCCTGATTCAAG GTTTTAGATTTAGTCTTTGAGTGATGCGGGTAATCGACTGCTTCTTCTAGG
genomic: GCTTAAACGGTAAAGAAGTGATTTAGATGCTGACATTTTCCTGATTCAAGgcaagtccca ... ttgcttgcagGTTTTAGATTTAGTCTTTGAGTGATGCGGGTAATCGACTGCTTCTTCTAGG
aggcttgtcttggtgcttgctgactcttgctgttgaattaaccttttgcttgcagGTTTTAGATTTAGTCTTTGAGTGATGCGGGTAATCGACTGCTTCTTCTAGGACTTGGAACTTAATGGGGGTAAACCCCTAGTCGGTGTGCTTGTGGTTTG
aattaac putative branch site (score: 2)
ccttttgctt CT-rich tract
ttgaattaa TA-rich tract