1 5' 3' | 2 5' 3' |
gtacgcacgcggtccacttccccccgcgcttctctttgccccaatccgatctgcttaccccctaccttcgtcgcgtgatccgtcgtctgaccccccgcgcgggactcttccctcccgccgcgcttgttgcagGTGTACTGGATGTACAGGTTAGCCTCGGACAAGCAGCCGCCGCGGAGGAAGACGCAGTAGCCACCACCACCACGGGCCCCGACGGCTTCGTGCTCGCCTT
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os02g26404.1 |
intron # | 1 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CCGTCCCGCTGTTTGTCGTCGTCCTCCTCNCCGCCCACGTCCTAGCCCTC GTGTACTGGATGTACAGGTTAGCCTCGGACAAGCAGCCGCCGCGGAGGAAGEST: gi|38477830|gb|CF961963.1|CF961963
genomic: CCGTCCCGCTCTTCGTCGTCGTCCTCCTCGCCGCCCACGTCCTAGCCCTCgtacgcacgc ... cttgttgcagGTGTACTGGATGTACAGGTTAGCCTCGGACAAGCAGCCGCCGCGGAGGAAG
EST: CCGTCCCGCTCTTCGTCGTCGTCCTCCTCGCCGCCCACGTCCTAGCCCTC GTGTACTGGATGTACAGGTTAGCCTCGGACAAGCAGCCGCCGCGGAGGAAGEST: gi|86891447|gb|CI308080.1|CI308080
genomic: CCGTCCCGCTCTTCGTCGTCGTCCTCCTCGCCGCCCACGTCCTAGCCCTCgtacgcacgc ... cttgttgcagGTGTACTGGATGTACAGGTTAGCCTCGGACAAGCAGCCGCCGCGGAGGAAG
EST: CCGTCCCGCTCTTCGTCGTCGTCCTCCTCGCCGCCCACGTCCTAGCCCTC GTGTACTGGATGTACAGGTTAGCCTCGGACAAGCAGCCGCCGCGGAGGAAGEST: gi|88474974|gb|CI412245.1|CI412245
genomic: CCGTCCCGCTCTTCGTCGTCGTCCTCCTCGCCGCCCACGTCCTAGCCCTCgtacgcacgc ... cttgttgcagGTGTACTGGATGTACAGGTTAGCCTCGGACAAGCAGCCGCCGCGGAGGAAG
EST: CCGTCCCGCTTTTTGTCTTCGTCCTCCTCGCCGCCCACGTCCTAGCCCTC GTGTACTGGATGTACAGGTTAGCCTCGGACAAGCAGCCGCCGCGGAGGAAGEST: gi|88331703|gb|CI640734.1|CI640734
genomic: CCGTCCCGCTCTTCGTCGTCGTCCTCCTCGCCGCCCACGTCCTAGCCCTCgtacgcacgc ... cttgttgcagGTGTACTGGATGTACAGGTTAGCCTCGGACAAGCAGCCGCCGCGGAGGAAG
EST: CCGTCCCGCTCTTCGTCGTCGTCCTCCTCGCCGCCCACGTCCTAGCCCTC GTGTACTGGATGTACAGGTTAGCCTCGGACAAGCAGCCGCCGCGGAGGAAGEST: gi|86257704|gb|CI064057.1|CI064057
genomic: CCGTCCCGCTCTTCGTCGTCGTCCTCCTCGCCGCCCACGTCCTAGCCCTCgtacgcacgc ... cttgttgcagGTGTACTGGATGTACAGGTTAGCCTCGGACAAGCAGCCGCCGCGGAGGAAG
EST: CCGTCCCGCTCTTCGTCGTCGTCCTCCTCGCCGCCCACGTCCTAGCCCTC GTGTACTGGATGTACAGGTTAGCCTCGGACAAGCAGCCGCCGCGGAGGAAGEST: gi|8956254|gb|BE230058.1|BE230058
genomic: CCGTCCCGCTCTTCGTCGTCGTCCTCCTCGCCGCCCACGTCCTAGCCCTCgtacgcacgc ... cttgttgcagGTGTACTGGATGTACAGGTTAGCCTCGGACAAGCAGCCGCCGCGGAGGAAG
EST: CCGTCCCGCTCTTCGTCGTCGTCCTCCTCGCCGCCCACGTCCTAGCCCTC GTGTACTGGATGTACAGGTTAGCCTCGGACAAGCAGCCGCCGCGGAGGAAGEST: gi|8956485|gb|BE230400.1|BE230400
genomic: CCGTCCCGCTCTTCGTCGTCGTCCTCCTCGCCGCCCACGTCCTAGCCCTCgtacgcacgc ... cttgttgcagGTGTACTGGATGTACAGGTTAGCCTCGGACAAGCAGCCGCCGCGGAGGAAG
EST: CCGTCCCGCTCTTCGTCGTCGTCCTCCTCGCCGCCCACGTCCTAGCCCTC GTGTACTGGATGTACAGGTTAGCCTCGGACAAGCAGCCGCCGCGGAGGAAGEST: gi|12622204|gb|AU172417.1|AU172417
genomic: CCGTCCCGCTCTTCGTCGTCGTCCTCCTCGCCGCCCACGTCCTAGCCCTCgtacgcacgc ... cttgttgcagGTGTACTGGATGTACAGGTTAGCCTCGGACAAGCAGCCGCCGCGGAGGAAG
EST: CCGTCCCGCTCTTCGTCGTCGTCCTCCTCGCCGCCCACGTCCTAGCCCTC GTGTACTGGATGTACAGGTTAGCCTCGGACAAGCAGCCGCCGCGGAGGAAG
genomic: CCGTCCCGCTCTTCGTCGTCGTCCTCCTCGCCGCCCACGTCCTAGCCCTCgtacgcacgc ... cttgttgcagGTGTACTGGATGTACAGGTTAGCCTCGGACAAGCAGCCGCCGCGGAGGAAG
atccgtcgtctgaccccccgcgcgggactcttccctcccgccgcgcttgttgcagGTGTACTGGATGTACAGGTTAGCCTCGGACAAGCAGCCGCCGCGGAGGAAGACGCAGTAGCCACCACCACCACGGGCCCCGACGGCTTCGTGCTCGCCTT
gtctgac putative branch site (score: 2)
ctcttccctcccgccg putative PPT