1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' |
...tacttaacaatcttcgttgtgcttcacattacttaaaacaaatccccatagactgatagacatgttgcccttcactgaccacgggagcttgctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGCAACCTGAAGGTTGGCTTCGCAGAGGCGGCATAATGCCCCCCATGGTGA
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os01g47410.1 |
intron # | 13 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGTTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|88848279|gb|CI086801.1|CI086801
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|88961195|gb|CI096599.1|CI096599
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|89162364|gb|CI104692.1|CI104692
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|66919051|gb|CX105899.1|CX105899
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|86490999|gb|CI133632.1|CI133632
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|86823254|gb|CI254102.1|CI254102
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|88990622|gb|CI108009.1|CI108009
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|88260092|gb|CI361593.1|CI361593
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|89175124|gb|CI111643.1|CI111643
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATAGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|89163381|gb|CI100271.1|CI100271
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|88502618|gb|CI430124.1|CI430124
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|88262487|gb|CI366261.1|CI366261
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCT- GATCTTGGGAGATGTCTTTAT-GGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|89174577|gb|CI110775.1|CI110775
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|89174564|gb|CI110762.1|CI110762
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|88512430|gb|CI439936.1|CI439936
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|88967838|gb|CI098080.1|CI098080
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|15849953|gb|BI798229.1|BI798229
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|88525445|gb|CI453986.1|CI453986
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|15847030|gb|BI795306.1|BI795306
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|2799539|gb|AA752528.1|AA752528
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTVGTGGTCCTCTSNG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGGRGCCTACCATACCGTEST: gi|86485963|gb|CI128596.1|CI128596
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGA-GCCTACCATACCGT
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|15848544|gb|BI796820.1|BI796820
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|86491950|gb|CI134583.1|CI134583
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|89165697|gb|CI102787.1|CI102787
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|86428765|gb|CI075446.1|CI075446
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GGTCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|86435036|gb|CI106269.1|CI106269
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|88835718|gb|CI370823.1|CI370823
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|88251440|gb|CI349868.1|CI349868
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|88289223|gb|CI553199.1|CI553199
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|88515707|gb|CI443361.1|CI443361
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|88956423|gb|CI092685.1|CI092685
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|3762082|gb|C99330.1|C99330
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|88468051|gb|CI517510.1|CI517510
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|15849091|gb|BI797353.1|BI797353
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|86485865|gb|CI128498.1|CI128498
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|88551666|gb|CI481744.1|CI481744
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|86492539|gb|CI135172.1|CI135172
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GACCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|86483624|gb|CI126257.1|CI126257
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|88262344|gb|CI366118.1|CI366118
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|89162553|gb|CI099245.1|CI099245
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|89165391|gb|CI102481.1|CI102481
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|88544497|gb|CI472600.1|CI472600
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCCTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|86489443|gb|CI132076.1|CI132076
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: GTCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGEST: gi|89181833|gb|CI113339.1|CI113339
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
EST: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTG GATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
genomic: ATCAGTGGATTCACAGCTATGGACATTCCTCCTCCTCGTGGTCCTCTCTGgtaaattatc ... gctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGG
ccatagactgatagacatgttgcccttcactgaccacgggagcttgctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGCAACCTGAAGGTTGGCTTCGCAGAGGCGGCATAATGCCCCCCATGGTGA
cactgac putative branch site (score: 62)
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| tacttaacaatcttcgttgtgcttcacattacttaaaacaaatccccatagactgatagacatgttgcccttcactgaccacgggagcttgctgttgcagGATCTTGGGAGATGTCTTTATGGGAGCCTACCATACCGTGTTTGACTATGGCAACCTGAAGGTTGGCTTCGCAGAGGCGGCATAATGCCCCCCATGGTGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CTGAAG
- - -aacaatc
- - - - - - - - - gtgcttc
- - - - - - - - - - - - - - - - - -aaacaaa