1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
gttggccgtcctttgcggagatttccttgacctttggtcacgcccctttgaattgctgtgctgctgtgaccatgctgctatggatgtttgttgatttttttttaaacatgttttcagGGTGCAGCGCTGCTTGAACTGCCTTGGAAAAGGCTACGCTTGAAGGGGCAATGCGTCCTTGCGTTTGGCTTATCGTTGGCCACTGGGATTTCCGCACG
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os01g42720.1 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GACCCGGTGTTCGTCAACCCGTGCCTCTGCCCTACCTGTGACGGGACTAG GGTGCAGCGCTGCTTGAACTGCCTTGGAAAAGGCTACGCTTGAAGGGGCAA
genomic: GACCCGGTGTTCGTCAACCCGTGCCTCTGCCCTACCTGTGACGGGACTAGgttggccgtc ... atgttttcagGGTGCAGCGCTGCTTGAACTGCCTTGGAAAAGGCTACGCTTGAAGGGGCAA
gctgtgaccatgctgctatggatgtttgttgatttttttttaaacatgttttcagGGTGCAGCGCTGCTTGAACTGCCTTGGAAAAGGCTACGCTTGAAGGGGCAATGCGTCCTTGCGTTTGGCTTATCGTTGGCCACTGGGATTTCCGCACG
tgttgat putative branch site (score: 6)
tgttttc putative PPT
tttgttgatttttttt TA-rich tract