Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

...ctttcaattgtattctttaattcttcaagtttattttatattcaactttgtaaaaccggacatttgtgctaaactgctgattgatatttgtgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCTTGGATGTGCCTCCTGGCAAAATGGGGCGTGTTATTGGCAGAAAAGGATC

Basic information

species Oryza sativa
transcript LOC_Os01g38620.2
intron # 6
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: LOC_Os01g38620.3 (Oryza sativa), 3'ss of exon 6
lower sequence: GRMZM2G142984_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 7
--ctttcaattgta--ttctttaattcttcaagttta-ttttatattcaactttgtaaaaccggacatttgtgctaaactgctgattgatatttgtgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCTTGGATGTGCCTCCTGGCAAAATGGGGCGTGTTATTGGCAGAAAAGGATC
   || ||  |||   |||||| |      || |||| | ||||    |  |||  |   | |    ||||  || |  || || |  || ||||||    | |||||| |||||  ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||
acattgcatctgttacttctttgaccaaataattttaatcttatcagtatgtttacattgcagagtgtttgcactga-ttgttgttccatgtttgtg----atagATGACATTGAGGCTGATGTTTATGTTCCTGAAGCCGATATCCTGTCAGTCTTAGATGTGCCTCCTGGGAAAATGGGACGAGTTATTGGCAGAAAGGGGTC

upper sequence: LOC_Os01g38620.3 (Oryza sativa), 3'ss of exon 6
lower sequence: GRMZM2G081924_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 7
ctttcaattgtattctttaattcttc-----aagttt----attttatattcaactttgtaaaaccggacatttgtgctaaactgctgattgatatttgtgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCTTGGATGTGCCTCCTGGCAAAATGGGGCGTGTTATTGGCAGAAAAGGATC
      |||| ||  |||| |||||      |||  |    |||||||    |  ||   |   | |    |||| ||| | ||| |  || || ||||||    | |||||  |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||| ||| |||||||| || |||||||||||||| || ||
----acattgcatcttttagttctttgaccaaagactttgaattttatcagtatgttgacatctcagagtgtttgcgctga-ctgatatttcatgtttgtg----atagATGGCATTGAAGCTGATGTTTATGTTCCTGAAGTTGATATCCTATCAGTCTTAGATGTTCCTCATGGGAAAATGGGACGAGTTATTGGCAGAAAGGGGTC
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|1632517|gb|C20246.1|C20246
EST:     CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|88847382|gb|CI011325.1|CI011325
EST:     CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|88202283|gb|CI202638.1|CI202638
EST:     CAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: CAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|5455349|gb|AU075592.1|AU075592
EST:     GCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: GCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|38475427|gb|CF959560.1|CF959560
EST:     CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGGGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|218496740|gb|FG958327.1|FG958327
EST:     CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|86842694|gb|CI341824.1|CI341824
EST:     TGCGGATT-GCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: TGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|27577389|gb|CB000084.1|CB000084
EST:     CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|86600577|gb|CI356334.1|CI356334
EST:     AAGTATGCGGATT-GCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: AAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|89185534|gb|CI052060.1|CI052060
EST:     AGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: AGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|86598239|gb|CI354856.1|CI354856
EST:     TAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: TAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|86871756|gb|CI331133.1|CI331133
EST:     TGCGGAGTTGCCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTCGATATCCTGTCAGTCT
genomic: TGCGGA-TTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|86538752|gb|CI178958.1|CI178958
EST:     CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|33795398|gb|CF323569.1|CF323569
EST:     CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTG
genomic: CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTG
EST: gi|2797264|gb|AA750558.1|AA750558
EST:     CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|88480662|gb|CI417933.1|CI417933
EST:     CTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: CTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|11171889|gb|AU164011.1|AU164011
EST:     CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|86892185|gb|CI332232.1|CI332232
EST:     CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|88272458|gb|CI386313.1|CI386313
EST:     TCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: TCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|88967306|gb|CI002494.1|CI002494
EST:     CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|86822549|gb|CI358056.1|CI358056
EST:     ATGCGGATT-GCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: ATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|109974656|gb|DT807029.1|DT807029
EST:     CATAAATGACACCAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|38481198|gb|CF965287.1|CF965287
EST:     CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGGCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|88219026|gb|CI220586.1|CI220586
EST:     CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|88834834|gb|CI370137.1|CI370137
EST:     GCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATT-AACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGT-GATATCCTGTCAGTCT
genomic: GCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|88965917|gb|CI006713.1|CI006713
EST:     CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|33681610|gb|CF309849.1|CF309849
EST:     CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|218500721|gb|FG955417.1|FG955417
EST:     CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|218499712|gb|FG957057.1|FG957057
EST:     CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|32948414|gb|BP184986.1|BP184986
EST:     CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|88257817|gb|CI360403.1|CI360403
EST:     CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|86540904|gb|CI181110.1|CI181110
EST:     CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGTCCACCCCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTGTATGTTCCTGAGATGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|88253685|gb|CI352311.1|CI352311
EST:     ACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATG-TTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: ACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|88844719|gb|CI021294.1|CI021294
EST:     CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|88840553|gb|CI080007.1|CI080007
EST:     CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|27577933|gb|CB000628.1|CB000628
EST:     CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|86835494|gb|CI347951.1|CI347951
EST:     CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|86836643|gb|CI347290.1|CI347290
EST:     ACAAGTATGGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: ACAAGTAT-GCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|86535832|gb|CI176038.1|CI176038
EST:     CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|88223217|gb|CI223066.1|CI223066
EST:     CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|15008152|gb|AU222540.1|AU222540
EST:     TCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: TCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|86420011|gb|CI054812.1|CI054812
EST:     CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|88269377|gb|CI380675.1|CI380675
EST:     AACAAGTATGCAGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: AACAAGTATGC-GGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|58590818|gb|CF989126.1|CF989126
EST:     GGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGTTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: GGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|86542597|gb|CI182803.1|CI182803
EST:     CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|218487806|gb|FG949430.1|FG949430
EST:     CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|88965918|gb|CI006714.1|CI006714
EST:     CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|2797475|gb|AA750769.1|AA750769
EST:     CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGG-CACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTGTGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|86540931|gb|CI181137.1|CI181137
EST:     CATAAAGGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCCCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGATGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|88970367|gb|CI383869.1|CI383869
EST:     TTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGT-GATATCCTGTCAGTCT
genomic: TTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|88272187|gb|CI388240.1|CI388240
EST:     CCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: CCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|88319583|gb|CI518427.1|CI518427
EST:     CAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: CAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|88997570|gb|CI390234.1|CI390234
EST:     CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
EST: gi|218499923|gb|FG954899.1|FG954899
EST:     CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTG                         ATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT
genomic: CATAAATGACAACAAGTATGCGGATTGGCCACCTCTTCCAACTGTCCCTGgtcagtgcat ... tgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCT


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

ctttgtaaaaccggacatttgtgctaaactgctgattgatatttgtgtcatacagATGAAATTGAACCTGATGTTTATGTTCCTGAGGTGGATATCCTGTCAGTCTTGGATGTGCCTCCTGGCAAAATGGGGCGTGTTATTGGCAGAAAAGGATC
                                  attgatattt  TA-rich tract