Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

AAACTGTGGCATTACATGGGCATATGAAGTAGCACACCAACCAATGCTATGCCCAATTATAGTTGAGGACATGAGTCTACCTGGCCAAATGCTTATAGAGgtatgatagaattgagaatgcatgttactttgtttatcatctgctatcctttggattgcctatgcaacattgaatccattggcattgctttgttgcag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA20G35920.1
intron # 8
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA20G35920.1 (Glycine max), 5'ss of exon 8
lower sequence: Vv02s0025g02310.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 8
AAACTGTGGCATTACATGGGCATATGAAGTAGCACACCAACCAATGCTATGCCCAATTATAGTTGAGGACATGAGTCTACCTGGCCAAATGCTTATAGAGgtatgatagaattgagaatgcatgttactttgtttatcatctgctatcctttggattgcctatgcaacattgaatccattggcattgctttgttgcag
   | ||||   ||||||||||| ||||||       ||| ||||| | |||||||||| |||||||||  | | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    ||  ||    | ||| | | | |  |||     | | ||  |   ||    | ||||||  |||    ||  | ||||||||
CGGCGGTGGTGCTACATGGGCATTTGAAGTCAGTGGTCAAACAATGGTTTGCCCAATTAGAGTTGAGGATCTTAATCCACCTGGCCAAATGCTTATAGAGgtat-atagaat----aagccaaagaaatttttatgtgaattgcctatttcttgaaggagaatatccctttgaatgtatttctgtt--tctgttgcag