Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

...gttgcttcttattattcttggttaccaatggtcccgtttttttcataatacatcgtctcaagttaataattggttacaaaatttgttaccaatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGAGAAGGGTGGAACCACAGCCACAAAGGCATCAGGACAGACCACGATACAA

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA20G34880.1
intron # 2
splice site 3'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|193683132|gb|FK623012.1|FK623012
EST:     GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
EST: gi|6726183|gb|AW310537.1|AW310537
EST:     GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
EST: gi|193544022|gb|FK500247.1|FK500247
EST:     GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
EST: gi|193475520|gb|FK440299.1|FK440299
EST:     GTTCGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
EST: gi|10235046|gb|BE803934.1|BE803934
EST:     GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
EST: gi|214006142|gb|DB988759.1|DB988759
EST:     GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
EST: gi|10709032|gb|BF008693.1|BF008693
EST:     GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTACAGAGATCACCTGAAAGACAGA
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
EST: gi|58023839|gb|CX710580.1|CX710580
EST:     GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
EST: gi|120531973|gb|EH260106.1|EH260106
EST:     GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACA
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACA
EST: gi|151406042|gb|EV275857.1|EV275857
EST:     GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
EST: gi|120493848|gb|EH222015.1|EH222015
EST:     GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
EST: gi|120532090|gb|EH260223.1|EH260223
EST:     GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGA
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGA
EST: gi|209708470|gb|BW665447.1|BW665447
EST:     GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
EST: gi|22928731|gb|BU545870.1|BU545870
EST:     GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
EST: gi|120531801|gb|EH259934.1|EH259934
EST:     GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
EST: gi|58023370|gb|CX710111.1|CX710111
EST:     GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
EST: gi|213608110|gb|DB970791.1|DB970791
EST:     GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAG
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAG
EST: gi|9900684|gb|BE609652.1|BE609652
EST:     GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
EST: gi|208213554|gb|GE010933.1|GE010933
EST:     GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
EST: gi|58018489|gb|CX705231.1|CX705231
EST:     GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
EST: gi|213606465|gb|DB976542.1|DB976542
EST:     GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
EST: gi|11414009|gb|BF425949.1|BF425949
EST:     GTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCCTGAGAACAAGGGACCTATGGGTG                         CTGAATAATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAG
genomic: GTGCTGCCGGATTCGTATGTTGAT-CCTGAGAACAA-GGA-CTAT-GGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAG
EST: gi|213604261|gb|DB978189.1|DB978189
EST:     GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
EST: gi|193371232|gb|FK338201.1|FK338201
EST:     GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
EST: gi|213593574|gb|DB977406.1|DB977406
EST:     GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
EST: gi|21638469|gb|BM139515.1|BM139515
EST:     TCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
genomic: TCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
EST: gi|209723278|gb|BW679875.1|BW679875
EST:     GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAA
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAA
EST: gi|209727501|gb|BW651970.1|BW651970
EST:     GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGNAAGACAGA
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
EST: gi|208325238|gb|GE118388.1|GE118388
EST:     GAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
genomic: GAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
EST: gi|208126746|gb|GD921202.1|GD921202
EST:     GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
EST: gi|209696886|gb|BW660451.1|BW660451
EST:     GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
EST: gi|207847271|gb|GD818198.1|GD818198
EST:     GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGGGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
EST: gi|58023619|gb|CX710360.1|CX710360
EST:     GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
EST: gi|57574044|gb|CX547019.1|CX547019
EST:     GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
EST: gi|120532102|gb|EH260235.1|EH260235
EST:     GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
EST: gi|213604102|gb|DB978682.1|DB978682
EST:     GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
EST: gi|192329912|gb|FK021498.1|FK021498
EST:     GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
EST: gi|120494372|gb|EH222539.1|EH222539
EST:     GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
EST: gi|209716171|gb|BW662343.1|BW662343
EST:     GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
EST: gi|7692505|gb|AW760609.1|AW760609
EST:     GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
EST: gi|192313700|gb|FK007628.1|FK007628
EST:     GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
EST: gi|23731729|gb|BU764005.1|BU764005
EST:     GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGCGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
EST: gi|151396963|gb|EV266836.1|EV266836
EST:     GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTG                         CTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA
genomic: GTTTGTGCTGCCGGATTCGTATGTTGATCCTGAGAACAAGGACTATGGTGgtgagggttt ... aatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGA


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

taatacatcgtctcaagttaataattggttacaaaatttgttaccaatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGAGAAGGGTGGAACCACAGCCACAAAGGCATCAGGACAGACCACGATACAA
               agttaat  putative branch site (score: 4)
                 ttaataattggttaca  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
gttgcttcttattattcttggttaccaatggtcccgtttttttcataatacatcgtctcaagttaataattggttacaaaatttgttaccaatgatgcagCTGAATTATTTGTGAATGGAGAGATCGTCCAGAGATCACCTGAAAGACAGAGAAGGGTGGAACCACAGCCACAAAGGCATCAGGACAGACCACGATACAA

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GGTGGA
- tgcttct
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -tgttacc