Mapped EST sequences
Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments
ATGC EST sequence
ATGC genomic sequence (exon)
ATGC genomic sequence (truncated intron)
EST:
gi|8282429|gb|BE020053.1|BE020053EST: GGCTCAACATTGTCATGGCTGATGCTGAGAACCCCAATTGGCTACCTGAG CTCCTTAATTATGATGTTAGCTATGTTCCTTGCTTTGTGCTTCTTGACAAC
genomic: GGCTCAACATTGTCATGGCTGATGCTGAGAACCCCAATTGGCTACCTGAGgtatcttatt ... cgaattgcagCTCCTTAATTATGATGTTAGCTATGTTCCTTGCTTTGTGCTTCTTGACAAC
EST:
gi|58025001|gb|CX711742.1|CX711742EST: GGCTCAACATTGTCATGGCTGATGCTGAGAACCCCAATTGGCTACCTGAG CTCCTTAATTATGATGTTAGCTATGTTCCTTGCTTTGTGCTTCTTGACAAC
genomic: GGCTCAACATTGTCATGGCTGATGCTGAGAACCCCAATTGGCTACCTGAGgtatcttatt ... cgaattgcagCTCCTTAATTATGATGTTAGCTATGTTCCTTGCTTTGTGCTTCTTGACAAC
EST:
gi|16345038|gb|BI970633.1|BI970633EST: GGCTCAACATTGTCATGGCTGATGCTGAGAACCCCAATTGGCTACCTGAG CTCCTTAATTATGATGTTAGCTATGTTCCTTGCTTTGTGCTTCTTGACAAC
genomic: GGCTCAACATTGTCATGGCTGATGCTGAGAACCCCAATTGGCTACCTGAGgtatcttatt ... cgaattgcagCTCCTTAATTATGATGTTAGCTATGTTCCTTGCTTTGTGCTTCTTGACAAC
EST:
gi|193335761|gb|FK301917.1|FK301917EST: GGCTCAACATTGTCATGGCTGATGCTGAGAACCCCAATTGGCTACCTGAG CTCCTTAATTATGATGTTAGCTATATTCCTTGCTTTGTGCTTCTTGACAAC
genomic: GGCTCAACATTGTCATGGCTGATGCTGAGAACCCCAATTGGCTACCTGAGgtatcttatt ... cgaattgcagCTCCTTAATTATGATGTTAGCTATGTTCCTTGCTTTGTGCTTCTTGACAAC
Putative cis-regulatory sequences
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
| | ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|
CAATTCCTTGCTCAAATTTGTCTCCGAAGTCGAAACCAGGAACTCTAATTGGCTCAACATTGTCATGGCTGATGCTGAGAACCCCAATTGGCTACCTGAGgtatcttatttttcacttatttgaccttaacaataggaattgagattactcttggattcattcattttggactgcacattgtgacaagagaatcatactt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGAT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ATGCTG